Набор для диагностики биодеградативного потенциала почв на основе полимеразной цепной реакции
ПЦР в реальном времени ПЦР диагностика почв экомониторинг
Изобретение представляет собой набор для оценки биодеградативного потенциала почв методом полимеразной цепной реакции в реальном времени с праймерами на ключевые гены биодеградации ароматических и алифатических углеводородов (нафталин-1,2-диоксигеназы и алкан монооксигеназы), а также rep-области плазмид групп несовместимости Р-7 и Р-9. В состав набора входят следующие компоненты:
1. Смесь дезоксирибонуклеозидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). 
2. Taq-ДНК-полимераза.
3. Буфер для ДНК-полимеразы, содержащий SYBR GreenI.
4. Праймеры для амплификации rep-области плазмид группы несовместимости Р-7.
5. Праймеры для амплификации rep-области плазмид группы несовместимости Р-9.
6. Праймеры для амплификации гена большой субъединицы нафталин-1,2-диоксигеназы, nahAc.
7. Праймеры для амплификации гена алкан монооксигеназы, alkB.
8. MgCl2, 1×1 мл.
9. Стерильная вода для ПЦР, 3×1.5 мл. 
10. Контрольная ДНК, 0.1 мл.
Оценка биодеградативного потенциала почв осуществляется путем детекции пороговых циклов амплификации (Ct) необходимых для формирования флуоресцентного сигнала в зависимости от количества копий тестируемых генов в реакционном объеме. В зависимости от уровня загрязнения если количество копий генов ≥106, то это свидетельствует о том, что исследуемый образец почвы  подвергся умеренному/сильному загрязнению ксенобиотиками. Если же кПЦР показывает количество копий генов  ≤105, то образец почвы может рассматриваться как чистый.
Использование предлагаемого набора является доступным, экологически безопасным и перспективным подходом в биотестировании и биомониторинге загрязнений окружающей среды.
Объемы перевозки нефтепродуктов все время возрастают, соответственно, и риск аварийного разлива нефти при ее транспортировке тоже растет. Также следует отметить, что единовременные выбросы в почву нефтепродуктов могут быть относительно невелики, но их постоянное действие может создавать значительный ареал устойчивого загрязнения почв. Тем не менее, почва обладает способностью самоочищаться от углеводородного загрязнения благодаря размножению микроорганизмов, способных существовать за счет одних лишь углеводородов.
Анализ существующих методов экологического мониторинга почв (патентный поиск) показывает, что в силу высокой стоимости и технологической сложности применение ряда из них является ограниченным. Поэтому эффективным подходом для определения степени токсичности почв, загрязненных продуктами переработки нефти и способности почвы к самоочищению, является использование методов биоиндикации и биотестирования. Однако способов, позволяющих в течение короткого периода наблюдения (до 5-ти часов) определить биодеградативный потенциал почв, не найдено. Особенностью предполагаемого использования данного РИД является наличие данной возможности.
Маргарита
Никитина
Анатольевна
исполнитель
Отсутствует
Отсутствует
-
-
РОССИЯ
Маргарита
Никитина
Анатольевна
исполнитель
РОССИЯ
34.05.17
Методы биологических исследований
34.27.23
Экология микроорганизмов
34.35.51
Антропогенные воздействия на экосистемы
01.06.QU
MICROBIOLOGY
02.08.DB
BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
04.01.AH
AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY
04.01.XE
SOIL SCIENCE
01.06.CO
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
Маргарита
Никитина
Анатольевна
автор патента
РОССИЯ
ФОНД СОДЕЙСТВИЯ ИННОВАЦИЯМ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФОНД СОДЕЙСТВИЯ РАЗВИТИЮ МАЛЫХ ФОРМ ПРЕДПРИЯТИЙ В НАУЧНО-ТЕХНИЧЕСКОЙ СФЕРЕ"
1027739479734
Организация
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере"
Федеральные государственные бюджетные учреждения
Маргарита
Никитина
Анатольевна
Физическое лицо
РОССИЯ