Протеом ленточного червя Schistocephalus solidus (Cestoda), паразита трехиглой колюшки Gasterosteus aculeatus, после температурного воздействия, имитирующего переход паразита из холоднокровного в теплокровного хозяина
биофармацевтика биотехнология протеом трансмембранный домен секреторная последовательность паразитический червь цестода Schistocephalus solidus метаболизм молекулярная структура состав белков
База данных предназначена для хранения информации о молекулярной структуре и регуляции метаболизма паразита рыб и рыбоядных птиц ленточного червя Schistocephalus solidus. Состав белков цестоды Schistocephalus solidus определяли в эксперименте, моделирующем переход паразита от хладнокровного хозяина к теплокровному. Данные получены путем паразитологического описания особей колюшки трехиглой, выловленной в июне 2019 г. в оз. Машинное (66°17′46.5″N 33°21′59.3″E). Данные об анализе масс-спектров были получены методом тандемной ВЭЖХ-масс-спектрометрии. Представлена информация о 1752 белках Schistocephalus solidus. База данных включает в себя: описание веса собранных червей, интенсивности заражения рыб, даты и условий проведения эксперимента (температуры и времени инкубации); уникальный идентификатор белков и данные об их обилии в каждом образце (LFQ intensity), количественные технические характеристики достоверности идентификации каждого белка по полученным масс-спектрам (Score, MS/MS count, Unique peptides, Potential contaminant и т.д.); идентификатор белка, его название, информацию о изменении содержания данного белка при культивации червей при 40°C и 22°C, функцию белка в терминах GO, наличие у него предсказанного трансмембранного домена и секреторной последовательности. База данных может быть использована для анализа молекулярных механизмов в основе отношений паразит-хозяин, а также для каталогизации молекул паразитических червей, имеющих биофармацевтический потенциал в качестве иммунорегуляторов или являющихся мишенями для разработки противогельминтных препаратов.
Научные исследования в области биологии, биофармацевтики, биомедицины
Максим
Тимофеев
Анатольевич
директор НИИ биологии ФГБОУ ВО "ИГУ"
Доктор биологических наук
Профессор
F-2071-2010
55899341800
93282
https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=
0000-0002-5250-6818
РОССИЯ
Александр
Шмидт
ректор, д.х.н., профессор
РОССИЯ
34.15.17
Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
34.33.15
Зоология беспозвоночных
34.33.23
Зоопаразитология
34.57.23
Методы получения биомедицинской информации
34.57.21
Материалы для биомедицинского применения
01.06.CQ
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
01.06.CO
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
01.06.ZM
ZOOLOGY
01.06.CU
BIOLOGY
Екатерина
Борвинская
Витальевна
РОССИЯ
Альбина
Кочнева
Александровна
РОССИЯ
Полина
Дроздова
Борисовна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБОУ ВО "ИГУ"
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Иркутский государственный университет"
1033801008218
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения