Частоты использования кодонов типовыми штаммами грибов
биотехнологии грибы генетический код Геномика
База данных предназначена для сбора, хранения и анализа частот использования кодонов в геномах типовых штаммов грибов. Ввиду избыточности генетического кода одна аминокислота может быть кодирована более чем одним триплетом нуклеотидов (кодонов). При этом синонимичные замены не влияют на структуру и функции белка, а замена минорных (редких) кодонов на синонимичные мажорные (частые) приводит к увеличению скорости синтеза пептидов. Таким образом, знание частот использования кодонов может помочь в выборе оптимальных кодонов для повышения эффективности трансляции гена для целей биотехнологии. Для 1 043 публично доступных геномов типовых штаммов грибов были предсказаны открытые рамки считывания и определены относительные частоты для каждого из 64 кодонов. Каждая запись сопровождается бинарной таксономией и таксономическим идентификатором NCBI для упрощения дальнейшей работы с базой.
Биоинженерия и биотехнология, в частности поиск оптимальных организмов-хозяев для продуцирования нужных белков для снижения затрат на кодоновую оптимизацию, а также определение перспективных организмов для поиска ферментов с заданными характеристиками использования кодонов
Максим
Патрушев
Владимирович
Заместитель руководителя Комплекса по научной работе
Кандидат биологических наук
Отсутствует
G-2792-2013
23498640600
141384
0000-0002-4748-9283
РОССИЯ
Кирилл
Борисов
Евгеньевич
Главный ученый секретарь Центра
РОССИЯ
34.27.21
Генетика и селекция микроорганизмов
34.15.27
Генетическая инженерия
20.53.19
Средства обработки и поиска информации
01.06.RQ
MYCOLOGY
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Алексей
Корженков
Александрович
РОССИЯ
Правительство России
Правительство Российской Федерации
Организация
-
-
НИЦ "КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ"
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ"
1027739576006
МАРАТ
КАМБОЛОВ
АРКАДЬЕВИЧ
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения