Программа для расчета значений совместной встречаемости пар биологических объектов из онтологии ЭНДСистем в текстах рефератов научных публикаций (ЭНДМатч) / Program for pairwise scoring of co-occurrences between biological objects from the ontology of ANDSystem in the unstructured texts of abstracts of scientific publications (ANDMatch)
ANDSystem text-mining анализ текстов со-встречаемость ассоциативные сети
Программа предназначена для расчёта значений совместной встречаемости пар биологических объектов из онтологии ANDSystem в текстах рефератов научных публикаций. Расчет частоты встречаемости для каждой пары объектов формируется из значений всех текстов рефератов, где данные объекты встречаются, а также числа отдельных предложений текстового корпуса с их совместным упоминанием. Программа работает более чем с 18 млн. биологических единиц из онтологии ANDSystem, разделенных на 13 типов: белки, гены, клеточные линии, клеточные компоненты, заболевания, лекарства, побочные действия лекарств, метаболиты, микроРНК, молекулярные функции, организмы, фенотипы, и биологические пути.
Программа может быть использована в области генетики, фармакологии, биоинформатики, а также других областях биологии и биомедицины.
Елена
Салина
Артемовна
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
U-1866-2019
7003403411
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
ученый секретарь
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Владимир
Иванисенко
Александрович
Адаптация алгоритмов. Написание кода программы. Тестирование и отладка.
РОССИЯ
Павел
Деменков
Сергеевич
Написание кода программы. Тестирование и отладка.
РОССИЯ
Тимофей
Иванисенко
Владимирович
Написание кода программы. Тестирование и отладка.
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения