База данных генотипов свиней
ГЕННЫЙ И ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ, ПЛЕМЕНЫЕ СВИНЬИ, МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ
База данных геномной вариабельности племенных свиней может использоваться как вспомогательный инструмент в геномной селекции свиней, обеспечивая быстрый доступ к данным генотипирования по множественным SNP локусам. Для создания базы данных использовался язык программирования Python 3 и фрэймворк SQLite. База данных была заполнена данными из 12 .csv файлов, содержащих информацию о результатах масштабного генотипирования образцов свиней с использованием микрочипов GGP HD Porcine Beadchip, часть столбцов была добавлена на основании этих данных.
-База данных позволяет хранить данные и получать их набор по соответствующему критерию (например, все данные о конкретном SNP или относящиеся к определённой породе). -База данных позволяет делать запросы по поиску данных по заданным пользователем характеристикам.-База данных позволяет делать запросы по анализу данных, содержащихся в ней.-База данных позволяет проводить просмотр, фильтрацию, сортировку, добавление, и удаление данных.
Хайтович Ф.Е.
Профессор
Кандидат биологических наук
Космодемьянская Н.В.
Руководитель отдела по исследовательским контрактам
68.39.35
Свиноводство
04.00.00
Agricultural Sciences
Елена
Мартынова
Уразовна
проводил генотипирование племенных свиней на чипах высокой плотности для получения данных по генотипам
Асия
Аюпова
Фаязовна
проводил генотипирование племенных свиней на чипах высокой плотности для получения данных по генотипам
Филипп
Хайтович
Ефимович
предложил структуру базы данных
Ольга
Костюнина
Васильевна
осуществлял сбор образцов для генотипирования
Дарья
Петрова
Андреевна
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
Наталия
Зиновьева
Анатольевна
предложил структуру базы данных
Александр
Ильин
Александрович
проводил разработку, пополнение и поддержание базы данных
Артемий
Шумский
Александрович
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
Полина
Огурцова
Алексеевна
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
ФГБНУ ФИЦ ВИЖ ИМ. Л.К. ЭРНСТА
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста"
1035011450913
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
Сколковский институт науки и технологий
Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования "Сколковский институт науки и технологий"
1115000005922
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Автономные некоммерческие организации