Спейсерные последовательности и консенсусные повторы CRISPR-Cas систем штаммов Pseudomonas aeruginosa
Нуклеотидные последовательности спейсеров Консенсусные повторы CRISPR-локусы штаммов Pseudomonas aeruginosa CRISPR-системы штаммов Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa
База данных предназначена для систематизации, хранения, анализа и быстрого поиска информации о нуклеотидных последовательностях 2380 спейсеров и 11 консенсусных повторов в CRISPR-локусах 184 штаммов Pseudomonas aeruginosa. База данных содержит: (1) общую информацию о штаммах, в геномах которых определены  CRISPR-локусы (название, номер штамма в NCBI, источник, год и страну выделения); (2) нуклеотидные последовательности и нумерацию консенсусных повторов, входящих в состав определенных CRISPR-локусов штаммов; (3) информацию о наличии/отсутствии определенных консенсусных повторов в CRISPR-локусах штаммов; (4) нуклеотидные последовательности и нумерацию спейсеров, а также количество CRISPR-локусов, в состав которых они входят; (5) информацию о наличии/отсутствии конкретных спейсеров в CRISPR-локусах штаммов.
База данных может быть использована для проведения сравнительного анализа структур CRISPR-систем штаммов Pseudomonas aeruginosa, филогенетических исследований, а также в преподавательской деятельности ВУЗов и колледжей медико-биологического профиля.
Владимир
Злобин
Игоревич
Профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии
Доктор медицинских наук
Академик
AAA-4041-2019
7004955483
76989799
https://orcid.org/0000-0002-0164-5113
000-0002-0164-51130
РОССИЯ
Игорь
Малов
Владимирович
Ректор
РОССИЯ
76.03.43
Медицинская микробиология
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Лилия
Степаненко
Александровна
Подбор и расположение материалов базы данных; разработка рубрикатора материалов базы данных; разработка словаря ключевых терминов материалов базы данных; аналитическое сопровождение полученных данных и составления документации;
РОССИЯ
Владимир
Злобин
Игоревич
Разработка рубрикатора материалов базы данных; разработка словаря ключевых терминов материалов базы данных
РОССИЯ
Юрий
Джиоев
Павлович
Разработка словаря ключевых терминов материалов базы данных
РОССИЯ
Надежда
Перетолчина
Павловна
Разработка структуры расположения материалов в базе данных
РОССИЯ
Андрей
Борисенко
Юрьевич
разработка рубрикатора материалов базы данных; аналитическое сопровождение полученных данных
РОССИЯ
Елена
Симонова
Васильевна
Разработка рубрикатора материалов базы данных; разработка словаря ключевых терминов материалов базы данных
РОССИЯ
Виктория
Бединская
Владимировна
Подбор и анализ материалов базы данных, разработка структуры расположения материалов в базе данных
РОССИЯ
ФГБОУ ВО ИГМУ Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Иркутский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
1023801539673
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
ФГБОУ ВО ИГМУ Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Иркутский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
1023801539673
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения