Программа сегментации гистологических изображений большого объема
гистологических изображения
Программа для ЭВМ предназначена для сегментации изображений большого объема, полученных путем оцифровки гистологических образцов на цифровом слайд-сканере (West Medica Vision Assist). Задача искусственной окраски гистологических образцов методами глубокого обучения требует получения значительного количества изображений - патчей для обучения соответствующих алгоритмов. Программа предлагает инструмент для сегментации входного большого интегрального слайда-изображения со слайд-сканера на отдельные изображения регулируемого размера и разрешения, которые будут применены для последующей разметки в рамках обучения нейросетевых алгоритмов. Для ускорения сегментации слайда-изображения и улучшения качества обучающей выборки был применен метод программного анализа генерируемых изображений - пропуск сегмента, если процентное отношение белых пикселей (на входном слайде-изображении белым цветом обозначены пустые зоны) в патче превышает установленное пороговое значение. Результатом работы программы является пронумерованный набор патчей-изображений и карта расположения их на оригинальном входном слайде-изображении.
В клинических и научных учреждениях кардиологического и терапевтического профиля
Антон
Кутихин
Геннадьевич
Заведующий лабораторией - Лаборатория молекулярной, трансляционной и цифровой медицины
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
В-9397-2012
36675316400
647572
0000-0001-8679-4857
РОССИЯ
Ольга
Барбараш
Леонидовна
директор
РОССИЯ
76.29.30
Кардиология и ангиология
03.00.00
Medical and Health Sciences
Лев
Богданов
Александрович
РОССИЯ
Антон
Кутихин
Геннадьевич
РОССИЯ
Евгений
Овчаренко
Андреевич
РОССИЯ
Павел
Онищенко
Сергеевич
РОССИЯ
Кирилл
Клышников
Юрьевич
РОССИЯ
Александр
Степанов
Денисович
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
НИИ КПССЗ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ КОМПЛЕКСНЫХ ПРОБЛЕМ СЕРДЕЧНО-СОСУДИСТЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ"
1034205024479
ОЛЬГА
БАРБАРАШ
ЛЕОНИДОВНА
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения