БЕЛКОВЫЙ ПРОФИЛЬ СМЫВОВ С ПОЛОСТИ ТЕЛА ТРЕХИГЛОЙ КОЛЮШКИ GASTEROSTEUS ACULEATUS L., НЕЗАРАЖЕННОЙ И ЗАРАЖЕННОЙ ПЛЕРОЦЕРКОИДАМИ ЦЕСТОДЫ SCHISTOCEPHALUS SOLIDUS (MULLER, 1776)
белки-мишени паразито-хозяинные отношения ВЭЖХ-масс-спектрометрия трехиглая колюшка Gasterosteus aculeatus L ленточный червь Schistocephalus solidus
База данных предназначена для хранения, анализа и обработки информации о молекулярных механизмах паразито-хозяинных отношений ленточного червя Schistocephalus solidus (Muller, 1776) и его промежуточного хозяина - трехиглой колюшки Gasterosteus aculeatus L. Методом тандемной ВЭЖХ-масс-спектрометрии идентифицирован состав белков в смывах с поверхности тела гельминта и с полости тела зараженных особей колюшки. В качестве контрольной группы использованы смывы с полости тела незаражённых рыб. Данные об интенсивности заражения получены путем паразитологического описания особей колюшки трехиглой, выловленной в июне 2020 года в оз. Машинное бассейна Белого моря, координаты 66°17′46.5″N 33°21′59.3″E. 
База данных представляет собой набор связанных таблиц, содержащих описание анализируемых образцов, «сырые» и обработанные результаты масс-спектрометрического анализа смывов, а также результаты сравнительного анализа белков колюшки и плероцеркоидов S. solidus в образцах, полученных от незаражённых и зараженных рыб. Всего представлена информация о 215 белках колюшки и паразита,  включает в себя описание пола, возраста, интенсивности заражения рыб, концентрацию белка в собранных смывах. А так же уникальный идентификатор обнаруженных белков, данные об их обилии в каждом образце (LFQ-intensity), количественные и качественные характеристики идентификации каждого белка по полученным масс-спектрам (Peptide counts (all), Peptide counts (razor+unique), Unique peptides, Sequence coverage, Q-value, Score, Potential contaminant, и т.д.), идентификатор белка и обработанные данные по LFQ-интенсивности белков трехиглой колюшки и плероцеркоидов S. solidus, идентифицированных в смывах с полости тела зараженных и незараженных рыб (проведена фильтрация данных и заполнение пропущенных значений методом bpca). В таблице 4 представлен список дифференциально экспрессируемых белков колюшки в смывах с полости тела незараженных и зараженных S. solidus рыб, включающий идентификатор (по UniprotKB) и название белка, информация об изменении содержания белка в образцах, наличие сигнального пептида и аннотация согласно терминам Gene ontology. Таблица 5 содержит идентификатор (по базе UniprotKB) и название белка, информация о присутствии белков S. solidus в смывах с полости тела зараженных рыб, наличие сигнального пептида и аннотацию согласно терминам Gene ontology.
База данных может быть использована для анализа молекулярных механизмов, лежащих в основе паразито-хозяинных отношений. Практическое значение базы данных заключается в каталогизации белков паразитических ленточных червей, которые быть использованы для поиска белков-мишеней при разработке ветеринарных препаратов (диагностических, антигельминтных). База данных может быть использована в научных и образовательных целях.
Паразитология
34.33.23
Зоопаразитология
Альбина
Кочнева
Александровна
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"AAB-5508-2019"
"57210802378"
"1007908"
"0000-0002-5866-9722"
РОССИЯ
Екатерина
Борвинская
Витальевна
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"AAV-1390-2020"
"45960996900"
"639338"
"https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=45960996900"
"0000-0003-4004-1440"
РОССИЯ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
ВАЛЕРИЙ
ФАЛЬКОВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
КАРНЦ РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "КАРЕЛЬСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1021000531133
ОЛЬГА
БАХМЕТ
НИКОЛАЕВНА
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "ИРКУТСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1033801008218
АЛЕКСАНДР
ШМИДТ
ФЕДОРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения