CtenophoraTrack
Mnemiopsis Leidyi гребневик миграции ImageJ wrMTrck_Batch ROI
Назначение: Программа разработана для определения основных характеристик движения биологических объектов на видеозаписях. Компьютерная программа позволяет автоматизировать обсчет характеристик движения биологических объектов по данным координат перемещения объектов, полученных с помощью программы ImageJ и плагина wrMTrck_Batch (txt-файлов). По значениям координат XY программа позволяет рассчитывать и записывать в новый txt файл значения мгновенных скоростей объектов, средние скорости для каждого трека движения (одно наблюдение за одним объектом), средние скорости по всем трекам, категоризованные значения векторов направления движения между всеми кадрами для каждого трека, нахождение объектов в определенных зонах - зонах интересов в зонах интересов (ROI) для каждого кадра, каждого трека (зоны задаются исходя из дизайна эксперимента по координатам XY). Программа опробована при изучении индивидуальных характеристик движения черноморских гребневиков Mnemiopsis Leidyi , выловленных из естественной популяции. Работа выполнена в рамках госзадания ФИЦ ИнБЮМ (№ гос. per. темы НИР АААА-А18-118020790229-7 от 07.02.2018). Область применения: биология, гидробиология, экология. Функциональные возможности программы ЭВМ: По входным данным: путь к директории с файлами, содержащими координаты движения; путь к файлу со значениями координат, описывающих зоны ROI; путь к директории для формирования результатов. Выдает следующие выходные данные: файлы (txt) для каждого трека движения объекта, содержащие исходные координаты, зоны ROI, разницы значений координат между кадрами (Δx1ΔУ), мгновенные скорости, векторы направления движения; файл, объединяющий результаты характеристик движения объектов по всем трекам (txt); файл, содержащий средние скорости движения для каждого трека (txt).
Программа может быть использована в научных и прикладных целях для анализа индивидуальных характеристик движения  в лабораторного условиях  различных полупрозрачных морских планктонных животных , например таких, как гребневики и медузы.
Евгения
Дмитриева
Вениаминовна
ведущий научный сотрудник
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
F-7986-2014
7006117358
742556
0000-0001-6300-2458
РОССИЯ
Роман
Горбунов
Вячеславович
директор
РОССИЯ
34.35.15
Организм и среда
01.06.PI
MARINE & FRESHWATER BIOLOGY
Юлия
Баяндина
Сергеевна
разраборка программного обеспечения
РОССИЯ
Ольга
Кулешова
Николаевна
Разработка программного обеспечения
РОССИЯ
ФАНО России
Федеральное агентство научных организаций
5137746009462
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
ФИЦ ИНБЮМ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ИНСТИТУТ БИОЛОГИИ ЮЖНЫХ МОРЕЙ ИМЕНИ А.О.КОВАЛЕВСКОГО РАН"
1159204018478
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения