Программный комплекс для дизайна синтетических цис-регуляторных элементов из последовательностей ДНК (GSGA) / Software package for the design of synthetic cis-regulatory elements from DNA sequences (GSGA)
улучшение цис-регуляторных элементов путем внесения однонуклетидных замен дизайн синтетических цис-регуляторных элементов
Программный комплекс (ПК) «GSGA» предназначен для дизайна синтетических цис-регуляторных элементов (полимеров) из последовательностей ДНК, содержащих отдельные сайты связывания (СС) целевого транскрипционного фактора (ТФ). ПК содержит блок создания полимера и блок его улучшения путем внесения однонуклетидных замен (ОНЗ). ПК генерирует популяцию решений, определенных для каждого блока как набор полимеров и набор паттернов ОНЗ для конкретного полимера, соответственно.
Программный комплекс может быть использован в биоинформатике и генетике для разработки структуры полимера и его последующего включения в состав промотора трансгена для его специфической экспрессии под действием целевого транскрипционного фактора.
Елена Васильевна
Землянская
Васильевна
с.н.с.
Кандидат биологических наук
Старший научный сотрудник
-
-
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
01.06.CU
BIOLOGY
Елена
Землянская
Васильевна
Разработка данных программы
РОССИЯ
Виктор
Левицкий
Георгиевич
Разработка алгоритма, программная реализация алгоритма, разработка данных программы, разработка спецификации программы.
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения