База данных по структурной реактомике метаболомного профиля пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника
энзимы структурная реактомика Метаболиты
Разработанная База данных (БД)  метаболитов и связанных с ними белков-переносчиков и ферментов выполнена в рамках Государственного задания. БД содержит 542 записи об уникальных метаболитах и связанных с ними белках-переносчиках и/или ферментах. Ресурс создавался для их поиска, в том числе структурных характеристик, информации о взаиморасположении метаболита и таргетного центра белка. С помощью данных по интегрированным мультиомным данным можно провести ряд исследований протеин-лигандных комплексов. БД может обеспечивать проверку гипотез моделирования реакции с измененными ферментами. Данные позволяют решить проблему рационального дизайна, а также, применима для исследований метаболического репрограммирования иммунных клеток. Информация о внесенных метаболитах может быть использована для изучения роли пост-трансляционных модификаций (ПТМ) в регуляции процессов метаболизма. В качестве объекта исследования выбираются ферменты, отвечающие за превращения определённых метаболитов в энтероцитах. Тип реализующей ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК Вид и версия операционной системы: Windows 11 Объем базы данных: 103 Кб
С помощью данных по интегрированным мультиомным данным можно провести ряд исследований протеин-лигандных комплексов. БД может обеспечивать проверку гипотез моделирования реакции с измененными ферментами. Данные позволяют решить проблему рационального дизайна, а также, применима для исследований метаболического репрограммирования иммунных клеток. Информация о внесенных метаболитах может быть использована для изучения роли пост-трансляционных модификаций  в регуляции процессов метаболизма. В качестве объекта исследования выбираются ферменты, отвечающие за превращения определённых метаболитов в энтероцитах.
Андрей
Лисица
Валерьевич
гл.н.с.
Доктор биологических наук
Академик
B-5260-2012
6701622135
108704
http://www.ibmc.msk.ru/?page_id=475
-
РОССИЯ
Елена
Пономаренко
Александровна
Директор
РОССИЯ
34.15.15
Пространственная структура и свойства биополимеров
03.01.DX
CHEMISTRY, MEDICINAL
Кирилл
Наход
Викторович
Ручной поиск энзимов и белков-переносчиков и их структурных и характеристик, свод БД
РОССИЯ
Артемий
Сахаров
Андреевич
Поиск сплайс-вариантов выбранных белков, установление связи с транскриптами
РОССИЯ
Алексей
Згода
Викторович
Моделирование фолдинга белка
РОССИЯ
Тимур
Шкригунов
Сергеевич
Консультирование по выбору 3D структур белков и их сопоставлению с метаболитами , поиск известных ПТМ выбранных белков, в том числе аддуктов
КАЗАХСТАН
Анна
Козлова
Сергеевна
Первичная обработка и анализ метаболомных данных, создание структуры БД
РОССИЯ
Андрей
Лисица
Валерьевич
Автор и координатор выбора методики определения основных структурных и квантово-химических характеристик ферментов и белков-переносчиков
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИБМХ
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
1027739053792
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения