Структура CRISPR-кассет и перечень бактериофагов, идентифицированных через расшифрованные спейсерные последовательности, в клинических изолятах Klebsiella pneumoniae, выделенных от детского населения Иркутской области
Klebsiella pneumoniae CRISPR-кассеты бактериофаги Спейсерные последовательности
База данных содержит материалы, систематизированные в таблицы, и предназначена для формализации самостоятельных материалов, обеспечения доступа, упрощения процесса поиска и обработки необходимой информации с помощью стандартных программ Windows. База содержит информацию о 27 бактериофагах, выявленных через нуклеотидные последовательности 146 спейсеров, расположенных в CRISPR-локусах 31 штамма Klebsiella pneumoniae, выделенных от детского населения, проживающего на территории Иркутской области. Спейсерные последовательности всех штаммов определены при секвенировании ПЦР продукта, полученного из генома клинических изолятов Klebsiella pneumoniae. База данных включает: общую информацию о штаммах (номер штамма в NCBI и индивидуальный номер); название; место, источник и год выделения; реестр спейсеров, входящих в состав CRISPR-кассет; реестр консенсусных повторов; реестр бактериофагов, содержащих в геноме гомологичные спейсерам последовательности. В базу включена упорядоченная и систематизированная информация о структуре CRISPR-кассет (нуклеотидные последовательности спейсеров и консенсусных повторов) и о бактериофагах (название и номер доступа к полному геному в NCBI), содержащих идентичные спейсерам протоспейсерные локусы, идентифицированных в геноме клинических изолятов Klebsiella pneumoniae, циркулирующих на территории Иркутской области среди детского населения. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-25-00449.
База данных может быть использована учеными и исследователями в области медицины и биотехнологий, а также в преподавательской деятельности ВУЗов и колледжей медико-биологического профиля.
Лилия
Степаненко
Александровна
Старший научный сотрудник
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
Q-4363-2017
57190748950
550176
0000-0002-5792-7283
РОССИЯ
Андрей
Щербатых
Викторович
Ректор
РОССИЯ
76.03.43
Медицинская микробиология
76.03.41
Медицинская вирусология
03.03.WV
SOCIAL SCIENCES, BIOMEDICAL
Лилия
Степаненко
Александровна
РОССИЯ
Владимир
Злобин
Игоревич
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ФГБОУ ВО ИГМУ Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Иркутский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
1023801539673
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения