Программа для подбора эндонуклеаз рестрикции для клонирования в сайт-направленного мутагенеза длинных генов
эндонуклеазы рестрикции сайт-направленный мутагенез
Программа позволяет автоматически выбрать сочетание(я) синонимичных кодонов в анализируемом фрагменте гена, которое содержит в себе сайт эндонуклеазы рестрикции заданного производителя ферментов. В случае, если не удается обнаружить нужные сочетания кодонов для исходного пептида, программа предлагает замены аминокислот в исходном пептиде на сходные используя матрицу сходства аминокислот BLOSUM62. В ходе выполнения программы необходимо указать белок-кодирующую последовательность ДНК клонируемого гена и ввести однобуквенный код производителя эндонуклеаз. Код автоматически выдаст сочетание синонимичных кодонов с указанием сайта эндонуклеазы, содержащегося в них.
Программа может быть использована при разработке методов клонирования и сайт-направленного мутагенеза длинных генов, таких как гены дистрофина, S-белка коронавирусов, CRISPR/Cas редакторов генома.
Дмитрий
Купраш
Владимирович
Руководитель центра
Доктор биологических наук
Член-корреспондент РАН
О-4899-2015
7003991201
80657
РОССИЯ
София
Георгиева
Георгиевна
Директор института
РОССИЯ
34.23.17
Биохимическая генетика
34.15.25
Молекулярная биология гена
34.15.33
Молекулярная иммунология
01.06.DR
CELL BIOLOGY
01.06.CQ
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Дмитрий
Карпов
Сергеевич
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИМБ РАН
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
1037736018066
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения