Программный комплекс для анализа сайтов связывания транскрипционных факторов (АССТФ) / The software for analysis of transcription factor binding sites (SFmotif)
сайт связывания транскрипционный фактор транскрипционный ответ
Программный комплекс (ПК) предназначен для структурно-функционального анализа сайтов связывания транскрипционных факторов в ChIP-seq данных Arabidopsis thaliana L. ПК состоит из трёх функциональных модулей, последовательно осуществляющих (I) поиск обогащенных мотивов (формальная модель сайта связывания), (II) поиск составных элементов между ними, (III) оценку их взаимосвязи с транскрипционным ответом генов. ПК выдаёт в качестве выходных данных модели и изображения мотивов или составных элементов, их аннотацию и графики ассоциации с транскрипционным ответом.
ПК может быть использован в биоинформатических исследованиях функциональной роли сайтов связывания транскрипционных факторов в регуляции транскрипции генов.
Елена
Землянская
Васильевна
с.н.с.
Кандидат биологических наук
Отсутствует
R-7125-2016
55960454400
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.23.03
Теоретическая генетика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Владислав
Долгих
Андреевич
РОССИЯ
Елена
Землянская
Васильевна
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ИЦИГ СО РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1025403657410
АЛЕКСЕЙ
КОЧЕТОВ
ВЛАДИМИРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения