«База данных для выявления регулируемых транскрипционным фактором STENOFOLIA генов» (STENODEGs)
экспрессия генов каллус бобовые регенерация транскрипционный фактор
База данных предназначена для выявления генов-регуляторов регенерации; генов-регуляторов каллусообразования; генов, регулируемыx транскрипционным фактором STENOFOLIA. Данные о каждом гене включают в себя следующие характеристики: Идентификатор гена (сборка 5.0), нормализованные числа прочтений, выровнявшихся на данный ген, на пробу, среднее число прочтений, выровнявшихся на данный ген, на пробу, логарифм по основанию 2 к отношению среднего числа прочтений, выровнявшихся на данный ген в пробах stf, к среднему числу прочтений, выровнявшихся на данный ген в пробах wt, стандартная ошибка предыдущего показателя, статистика Вальда, p-уровень значимости различий между опытными и контрольными пробами, p-уровень значимости различий между опытными и контрольными пробами с учетом поправки Беньямини-Хохберга на множественные сравнения, идентификатор гена (версия 4.0), аннотация гена. К преимуществам данной базы данных (по отношению к известным) относятся:
-Возможность поиска генов, регулируемых транскрипционным фактором STENOFOLIA и работающих в ходе развития каллусов в культуре in vitro. 
-Описание уровней экспрессии всех известных на настоящий момент генов люцерны за счет использования самой последней аннотации генома этого вида
С использованием РИД можно получить или усовершенствовать следующие продукты:
1. Модели регуляции развития соматических эмбрионов;
2. Модели регуляции развития каллусов;
3. Модели работы белка STENOFOLIA в клеточной культуре;
4. Методики регенерации и трансформации люцерны и других растений.
Игорь
Тихонович
Анатольевич
Профессор
Доктор биологических наук
Академик
C-1744-2014
6701578749
6685-9419
0000-0001-8968-854X
РОССИЯ
Елена
Лебедева
Витальевна
Начальник Управления научных исследований
РОССИЯ
34.15.25
Молекулярная биология гена
34.15.49
Молекулярная биология развития и старения
34.31.33
Культура тканей и органов растений
01.06.HY
DEVELOPMENTAL BIOLOGY
01.06.DE
PLANT SCIENCES
Варвара
Творогова
Евгеньевна
РОССИЯ
Людмила
Лутова
Алексеевна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
1037800006089
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения