Программа для объединения и выравнивания нуклеотидных последовательностей NucleoCom
виртуальная лаборатория обработка и анализ данных биоразнообразие биоклиматическое моделирование цифровая инвентаризация биоты Алтая система обработки больших объемов данных машинное обучение искусственный интеллект
Программа предназначена для объединения различных фрагментов нуклеотидных последовательностей (молекулярных маркеров) для операционных таксономических единиц (OTU) из пересекающихся списков в единый файл с последующим выравниванием по алгоритму MAFFT. С помощью программы решается проблема автоматизации рутинных операций объединения последовательностей с различными наименованиями одних и тех же OTU для разных молекулярных маркеров, а также оперативное изменение состава OTU и молекулярных маркеров в результирующем файле. Входные файлы: файл csv-формата с названиями последовательностей, fasta-файлы, содержащие последовательности. Выходной файл содержит объединенные последовательности (могут быть выравнены по запросу пользователя). Тип ЭВМ: IBM PC - совмест. ПК; ОС: Windows 8-11.
С помощью данной программы решается проблема автоматизации рутинных операций объединения последовательностей с различными наименованиями одних и тех же OTU для разных молекулярных маркеров, а также оперативное изменение состава OTU и молекулярных маркеров в результирующем файле.
20.53.19
Средства обработки и поиска информации
Евгений
Давыдов
Александрович
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"K-4521-2013"
"30467563400"
"179633"
"https://www.asu.ru/search/persons/542/"
"0000-0002-2316-8506"
РОССИЯ
Ольга
Кротова
Сергеевна
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"997598"
"https://www.elibrary.ru/author_profile.asp?authorid=997598"
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБОУ ВО "АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ",АЛТГУ,АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1022201770106
СЕРГЕЙ
БОЧАРОВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения