«Программа для деконволюции штаммов Sars-Cov-2 с использованием графов сборки» (wastewaterSPAdes)
сточные воды коронавирус Геномная сборка Деконволюция вирусов
wastewaterSPAdes, способен деконволировать штаммы Sars-Cov-2 в сточных водах без необходимости выравнивания прочтений. Наши результаты показывают, что wastewaterSPAdes точно определяет штаммы, присутствующие в образце, и правильно оценивает их распространенность в большинстве образцов.
К преимуществам данной программы (по отношению к известным) относятся:
•	отсутствие требований к качеству прикладывания прочтений к референсному геному;
•	Гибкое алгоритмическое решение, использующее программный код семейства программ SPAdes;
•	удобство и простота использования;
•	высокая точность результатов деконволюции
Данный РИД может быть использован для слежением за уровнем представленности штаммов Sars-Cov-2 в сточных водах и составе штаммов
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
Дмитрий
Мелешко
Алексеевич
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"С-7803-2018"
"57194195798"
"9245-0155"
"0000-0002-7398-9820"
РОССИЯ
Правительство России
Правительство Российской Федерации
Организация
-
-
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1037800006089
НИКОЛАЙ
КРОПАЧЕВ
МИХАЙЛОВИЧ
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения