База данных генотипов свиней
ГЕННЫЙ И ГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ, ПЛЕМЕНЫЕ СВИНЬИ, МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ
База данных геномной вариабельности племенных свиней может использоваться как вспомогательный инструмент в геномной селекции свиней, обеспечивая быстрый доступ к данным генотипирования по множественным SNP локусам. Для создания базы данных использовался язык программирования Python 3 и фрэймворк SQLite. База данных была заполнена данными из 12 .csv файлов, содержащих информацию о результатах масштабного генотипирования образцов свиней с использованием микрочипов GGP HD Porcine Beadchip, часть столбцов была добавлена на основании этих данных.
-База данных позволяет хранить данные и получать их набор по соответствующему критерию (например, все данные о конкретном SNP или относящиеся к определённой породе). -База данных позволяет делать запросы по поиску данных по заданным пользователем характеристикам.-База данных позволяет делать запросы по анализу данных, содержащихся в ней.-База данных позволяет проводить просмотр, фильтрацию, сортировку, добавление, и удаление данных.
Хайтович Ф.Е.
Профессор
Доктор биологических наук
Космодемьянская Н.В.
Руководитель отдела по исследовательским контрактам
68.39.35
Свиноводство
04.00.00
Agricultural Sciences
Александр
Ильин
Александрович
проводил разработку, пополнение и поддержание базы данных
Наталия
Зиновьева
Анатольевна
предложил структуру базы данных
Полина
Огурцова
Алексеевна
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
Артемий
Шумский
Александрович
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
Филипп
Хайтович
Ефимович
предложил структуру базы данных
Елена
Мартынова
Уразовна
проводил генотипирование племенных свиней на чипах высокой плотности для получения данных по генотипам
Дарья
Петрова
Андреевна
проводил выделение геномной ДНК из образцов ткани племенных свиней и оценку, которые были использованы для генотипирования
Ольга
Костюнина
Васильевна
осуществлял сбор образцов для генотипирования
Асия
Аюпова
Фаязовна
проводил генотипирование племенных свиней на чипах высокой плотности для получения данных по генотипам
ФГБНУ ФИЦ ВИЖ ИМ. Л.К. ЭРНСТА
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста"
1035011450913
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
Сколковский институт науки и технологий
Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования "Сколковский институт науки и технологий"
1115000005922
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Автономные некоммерческие организации