Автоматизированная обработка результатов секвенирования вирусов гриппа А
вирус гриппа секвенирование генотипирование субтип
Реферат

Автоматизированная обработка результатов секвенирования вирусов гриппа А

Все предыдущие пандемии человеческого гриппа были вызваны вирусом гриппа А (ВГА), представляющим наибольшую угрозу среди гетерогенной группы вирусов гриппа. На сегодняшний день существует понимание исключительно высокой изменчивости ВГА вкупе со знанием о фрагментарности реального природном разнообразии ВГА. 
 На сегодняшний день методом выбора идентификации ВГА является применение методов высокопроизводительного секвенирования (преимущественно платформа корпорации Illumina). При этом существуют готовые решения для отдельных этапов выполнения анализа, которые не являются рутинными и требуют наличия в штате квалифицированного биоинформатика, способного создавать пайплайны на основании таких готовых решений. Разработанный нами подход представляет собой проприетарное программное обеспечение, которое позволяет выполнять автоматизированную обработку результатов секвенирования вирусов гриппа А сотруднику, не обладающему навыками биоинформатической работы.
Данная разработка может быть использована для автоматизированного анализа результатов высокопроизводительного секвенирования
Павел
Волчков
Юрьевич
Ведущий научный сотрудник - заведующий лабораторией
Кандидат биологических наук
Отсутствует
H-4743-2013
12792924200
166498
https://orcid.org/ 0000-0001-9794-6297
РОССИЯ
Сергей
Гаричев
Николаевич
Директор по исследованиям, разработкам и коммерциализации
РОССИЯ
34.25.21
Генетика вирусов
34.25.05
Методы и аппаратура в вирусологии
34.57.23
Методы получения биомедицинской информации
Андрей
Девяткин
Андреевич
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"-"
"-"
"-"
"-"
РОССИЯ
Павел
Волчков
Юрьевич
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"H-4743-2013"
"12792924200"
"166498"
"0000-0001-9794-6297"
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
МФТИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ФИЗИКО-ТЕХНИЧЕСКИЙ ИНСТИТУТ (НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ)"
1027739386135
НИКОЛАЙ
КУДРЯВЦЕВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения