Программа для обучения графовой нейронной сети предсказанию ассоциативных связей между вершинами графа (ЭНДИнтерКоммон) / A program for deep machine learning of a graph neural network to predict associative interactions between vertices of a graph (ANDInterCommon)
графовые нейронные сети машинное обучение со-встречаемость предсказание взаимодействий ANDDigest ANDSystem
Программа осуществляет глубокое машинное обучение двух моделей с целью предсказания вероятности связи между парами объектов на основе схожести их окружений в графе. Входными данными является топология ассоциативной генной сети, представленная в виде пар взаимодействующих вершин. Дополнительным входным параметром является числовое значение совместного упоминания этих пар в текстах научных публикаций. Выходными данными являются матрица векторных представлений вершин графа, содержащих информацию о его топологии, а также обученная модель для предсказания взаимодействий на основе этих векторов.
Программа может быть использована для решения широкого круга задач, связанных с изучением процессов в живых организмах, в тех случаях, когда информация о взаимодействии слабо представлена, или отсутствует в литературе, а также для осуществления взвешивания рёбер в исходном графе.
Елена
Салина
Артемовна
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
U-1866-2019
7003403411
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.CU
BIOLOGY
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Тимофей
Иванисенко
Владимирович
РОССИЯ
Павел
Деменков
Сергеевич
РОССИЯ
Владимир
Иванисенко
Александрович
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦИГ СО РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1025403657410
АЛЕКСЕЙ
КОЧЕТОВ
ВЛАДИМИРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения