База данных представленности транскриптов в стволе мозга взрослых крыс (ПТСМВК) / A database  of  adult rats brainstem transcripts representation (ARBTR)
транскриптом Крысы Вистар ствол мозга представленность транскриптов обработка дуплекс специфичной нуклеазой, ДСН(DSN)
База данных (БД) предназначена для хранения информации о представленности транскриптов в стволе мозга врослых крыс линии Вистар. БД содержит представленность транскриптов ствола мозга взрослых крыс до и после нормализации. Половина из каждой библиотеки для массового параллельного секвенирования (NGS) была нормализована дуплекс специфичной нуклеазой (ДСН) из камчатского краба, которая используется для удаления высоко представленных последовательностей. Однако метод основан на ренатурации ДНК, и элиминация последовательностей может быть не всегда линейной и легко предсказуемой
База данных представляет интерес для широкого круга физиологов, нейробиологов и генетиков для поиска информации о представленности транскриптов и экспрессии генов в стволе мозга взрослых крыс линии Вистар. Данные могут быть использованы для последующего математического и статистического анализа. Также, БД может быть использована в анализе и планировании экспериментов с использованием нормализации NGS библиотек методами, основанными на ренатурации ДНК и обработкой дуплекс специфичной нуклеазой ДСН
Дмитрий
Ланшаков
Александрович
с.н.с.
Кандидат биологических наук
Отсутствует
M-7975-2016
34872521600
665376
http://assa.bionet.nsc.ru/open/person/1308/
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.39.15
Общая нейрофизиология
83.77.37
Статистические банки и базы данных
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Дмитрий
Ланшаков
Александрович
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦИГ СО РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1025403657410
АЛЕКСЕЙ
КОЧЕТОВ
ВЛАДИМИРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения