Программа для автоматической реконструкции математических моделей регуляции транскрипции генов микробов (МикроТранскриптМод) / The program for automatic reconstruction of mathematical models of microbial gene transcription regulation (MicroTranscriptMod)
математическая модель транскрипция оперон регуляция транскрипции
Программа «МикроТранскриптМод» выполняет автоматическую реконструкцию математической модели в терминах обобщенных функций Хилла. Входные данные для программы задаются в виде списка транскрипционных факторов, координат их сайтов связывания в регуляторной области гена и типе воздействия на процесс. Программа с помощью оригинального алгоритма эффективного перебора всех допустимых вариантов взаимодействия транскрипционных факторов с промотором вычисляет все возможные функционально-активные состояния регуляторной области гена и выводит формулу, описывающую мгновенную скорость экспрессии гена.
Программа может быть использована в организациях, занимающихся исследованиями в области системной биологии микробов.
Елена
Салина
Артемовна
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
U-1866-2019
7003403411
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Федор
Казанцев
Владимирович
Разработка алгоритма, программная реализация алгоритма, разработка данных программы, разработка спецификации программы
РОССИЯ
Татьяна
Лахова
Николаевна
Разработка алгоритма, программная реализация алгоритма, разработка данных программы, разработка спецификации программы
РОССИЯ
Сергей
Лашин
Александрович
Разработка алгоритма, программная реализация алгоритма, разработка данных программы, разработка спецификации программы
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения