Программа для ЭВМ "AmpliSep"
NGS, таргетное секвенирование
ПО предназначено для работы с .bam файлами, содержащими данные высокопроизводительного параллельного секвенирования, полученные с использованием технологии таргетного обогащения на основе мультиплексной ПЦР. Основной функцией данного ПО является разбиение картированных на референсный геном прочтений по пулам, в соответствии с дизайном эксперимента, что позволяет осуществлять поиск точковых мутаций и изменений копийности участков ДНК нивелировав как вклад пересекающихся таргетных регионов в аллельную частоту генетических вариантов, так и различия в общем количестве прочтений между отдельными пулами.
Для работы с .bam файлами и при работе с данными высокопроизводительного параллельного секвенирования.
Стрельников В.В.
Заведующий лабораторией
Куцев С. И.
Директор
50.41.25
Прикладное программное обеспечение
50.53.17
Автоматизация сбора и обработки данных научного эксперимента
01.02.EV
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
Кристина
Карандашева
Олеговна
Разработка алгоритма. Системное программирование.
ФГБНУ «МГНЦ»
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
1027739609480
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
ФГБНУ «МГНЦ»
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
1027739609480
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения