Программа для подбора сетов адаптеров с баркодами для платформ MGISEQ “BС-store»
MGISEQ, адаптеры, секвенирование, barcodes, баркоды, анализ набора адаптеров
Программа представляет собой единый скрипт, предназначенный для анализа набора баркодов на возможность одновременного использования при секвенировании. В скрипте реализована возможность вводить данные, что позволяет пользователю самостоятельно задавать исследуемый набор баркодов, их концентрации, название запуска секвенирования и длину одного баркода. Программа предоставляет пользователю отчет, представляющий собой анализ введенного набора баркодов по трем характеристикам в рамках строгого и нестрогого критериев в виде текста, таблиц и наглядных графиков.
Программа позволяет оптимизировать подбор адаптеров при секвенировании в случае различного соотношения долей
Коростин Д.О.
Старший научный сотрудник
Доктор наук
Лукьянов С. А.
Ректор
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
76.03.33
Медицинская цитология
02.06.00
Medical engineering
01.06.DR
CELL BIOLOGY
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Ирина
Булушева
Алексеевна
Разработка алгоритма, поиск критериев на основе опытных данных, программная реализация задачи
Валерий
Черанев
Владимирович
Тестирование программы
Дмитрий
Коростин
Олегович
Формулировка технического задания
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО РНИМУ ИМ. Н.И. ПИРОГОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "РОССИЙСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ Н.И. ПИРОГОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1027739054420
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения