Способ молекулярно-генетического типирования штаммов Klebsiella pneumoniae с использованием INDEL-маркеров
ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ТИПИРОВАНИЕ KLEBSIELLA PNEUMONIAE INDEL-МАРКЕРЫ ДНК ПЦР
Изобретение относится к области медицинской микробиологии, а именно к лабораторной диагностике, и может быть использовано при молекулярно-генетическом внутривидовом типировании штаммов Klebsiella pneumoniae, циркулирующих в объектах на различных территориях, с целью их дифференциации. Способ молекулярно-генетического типирования с использованием INDEL-маркеров включает выделение ДНК из исследуемого штамма, постановку ПЦР со специфическими праймерами и учет реакции после электрофореза. Амплификацию ДНК исследуемого штамма проводят с набором 11 праймеров к INDEL-маркерам Klebsiella pneumoniae, имеющих два альтернативных аллеля, а именно: с праймерами к гену MsyB, к гену AraC, к гену TraD, к гену pol-deac, к гену Galactose, к гену OmpC, к гену 8455, к гену 23015, к гену 23215, к гену 12905 и к гену 13875. Учет результатов амплификации проводят с помощью электрофореза в 10% полиакриламидном геле с последующим детектированием размера каждого INDEL-локуса. По полученным размерам аллелей выстраивают с помощью алгоритма UPGMA дендрограмму, по которой осуществляют типирование штаммов Klebsiella pneumoniae, определяя общее или различное происхождение исследуемых штаммов и возможных путей их распространения. Предлагаемый способ позволяет достоверно и быстро осуществлять типирование штаммов.
Предлагаемый способ может быть использован при молекулярно-генетическом внутривидовом типировании штаммов Klebsiella pneumoniae, циркулирующих в объектах на различных территориях, с целью их дифференциации.
Наталья
Павлович
Владимировна
Главный научный сотрудник, и.о. начальника отдела
Доктор медицинских наук
Отсутствует
-
-
85206
https://orcid.org/0000-0001-8287-4294
0000-0001-8287-4294
РОССИЯ
Алексей
Носков
Кимович
Директор
РОССИЯ
34.27.05
Методы и аппаратура в микробиологии
34.27.21
Генетика и селекция микроорганизмов
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Сергей
Водопьянов
Олегович
РОССИЯ
Руслан
Писанов
Вячеславович
РОССИЯ
Алексей
Водопьянов
Сергеевич
РОССИЯ
Игорь
Олейников
Павлович
РОССИЯ
РОСПОТРЕБНАДЗОР
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
1047796261512
АННА
ПОПОВА
ЮРЬЕВНА
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные казенные учреждения
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Федеральное казённое учреждение здравоохранения "Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1026103278959
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные бюджетные учреждения