"База данных геномных вариантов микобактерии туберкулеза" (GMTV)
ПОЛНОГЕНОМНЫЙ ПОИСК АССОЦИАЦИЙ, СЕКВЕНИРОВАНИЕ, ЛЕКАРСТВЕННАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ, ОМИКСНЫЕ ДАННЫЕ, МИКОБАКТЕРИИ ТУБЕРКУЛЕЗА, ГЕНОМНЫЕ ВАРИАНТЫ
База данных объединяет клиническое, эпидемиологическое и микробиологическое описание геномных вариаций Mycobacterium tuberculosis на основе данных секвенирования всего генома. В настоящее время база данных содержит геномную информацию о 2819 штаммах. Благодаря объединению всех этих типов данных возможно производить статический анализ аннотированных вариантов, в том числе с помощью полногеномного поиска ассоциаций. Этот ресурс служит отправной точкой для многих исследований лекарственной устойчивости бактерий Mycobacterium tuberculosis. Ценностью этой базы данных является доступность её для научного сообщества.
Коммерческая значимость созданной в рамках указанной темы НИР базы данных состоит в предоставлении уникального объединения клинического, эпидемиологического и микробиологического описания геномных вариаций Mycobacterium tuberculosis, что позволит произвести анализ закономерностей генетической связи обнаруженных вариантов с филогенией в контексте динамики развития лекарственной устойчивости патогенных бактерий. Конкретное использование регистрируемой базы данных: предполагается создание МИП (малого инновационного предприятия) в рамках СПбГУ на основе зарегистрированной в государственном Реестре базы данных Свидетельства РФ.
Роткевич М.С.
Научный сотрудник
Лебедева Е.В.
Начальник Управления научных исследований
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Петр
Яблонский
Казимирович
15%
Алла
Лапидус
Львовна
15%
Михаил
Роткевич
Сергеевич
25%
Вячеслав
Журавлев
Юрьевич
15%
Стефан
О’Брайен
Джеймс
15%
Екатерина
Черняева
Николаевна
15%
Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
1037800006089
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения