База данных результатов метагеномных исследований кишечника
метагеном 16S таксономия микроорганизмов микробиом кишечника данные секвенирования
Биоинформатическая база данных предназначена для хранения единого массива таксономических данных, полученных в ходе проведения секвенирования вариабельных участков гена 16S рРНК бактерий. Обработка данных проводится на основе референской базы данных SILVA (версия 2)  c использованием специализированного пакета программ QIIME (версия 138). Исходные данные обрабатываются и преобразуются в массив таксономических данных, в результате для каждого образца формируется список, содержащий уникальные варианты нуклеотидных последовательностей (ASV), определяющих таксономическую принадлежность микроорганизмов и их относительное количество. Наполнение базы данных происходит путем загрузки документа, который содержит данные после проведения первичной биоинформатической обработки. Архитектура БД представляет собой документо-ориентированную систему, состоящую из единого массива данных, открыта к пополнению.
База данных может быть использована для клинико-диагностических и научно-исследовательских целей при подборе и анализе эффективности лекарственных и пробиотических препаратов.
Альберт
Ризванов
Анатольевич
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
H-4486-2013
6507161167
504414
https://kpfu.ru/Albert.Rizvanov
0000-0002-9427-5739
РОССИЯ
Дмитрий
Таюрский
Альбертович
Первый проректор - проректор по научной деятельности
РОССИЯ
20.23.17
Информационно-поисковые массивы. Базы данных. Манипулирование данными и файлами
83.77.37
Статистические банки и базы данных
01.02.EV
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
01.02.EW
COMPUTER SCIENCE, SOFTWARE ENGINEERING
Аида
Габдулхакова
Габдрахмановна
РОССИЯ
Рамиль
Фарзалеев
Халилович
РОССИЯ
Регина
Тамбовцева
Сергеевна
РОССИЯ
Евгения
Булыгина
Александровна
РОССИЯ
Лейсан
Мингазова
Айдаровна
РОССИЯ
Алла
Мартьянова
Геннадьевна
РОССИЯ
Юлия
Филина
Викторовна
РОССИЯ
Сайяр
Абдулхаков
Рустамович
РОССИЯ
Татьяна
Григорьева
Владимировна
РОССИЯ
Альберт
Ризванов
Анатольевич
РОССИЯ
Регина
Мифтахова
Рифкатовна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО "КАЗАНСКИЙ (ПРИВОЛЖСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ", ФГАОУ ВО КФУ, КФУ, КАЗАНСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ, КАЗАНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ, КАЗАНСКИЙ (ПРИВОЛЖСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "КАЗАНСКИЙ (ПРИВОЛЖСКИЙ) ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1021602841391
ИЛЬШАТ
ГАФУРОВ
РАФКАТОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения