Программа анализа флуоресцентного имиджинга для лабораторного использования с функционалом автоматического детектирования клеточной активности в монокультурах
флуоресцентный имиджинг кальциевая активность детектирование кальциевых событий компьютерное зрение
Программа для ЭВМ предназначена для исследования механизмов взаимодействия клеток в моноастроцитарных культурах, обусловленного пространственно-временной передачей кальция. В программе реализованы возможности фильтрации исходных изображений с микроскопа в трёх форматах, выравнивания изображений при сдвиге камеры, выделения базовой линии сигнала, а также выделения сигналов и кальциевых событий отдельных астроцитов. В программе предусмотрена возможность визуализации всех шагов алгоритма, результатов обработки с помощью демонстрации серии изображений во времени и построения графиков изменения обработанной кальциевой интенсивности событий, а также экспорт данных в различных файловых форматах, таких как таблицы, изображения, видео-файлы, текстовые файлы, MAT-файлы. Сфера применения программы – фундаментальные исследования в области нейробиологии, обработка и анализ экспериментальных данных кальциевой активности моноастроцитарных культур.
Применение данного ПО возможно в научно-исследовательских лабораториях для проведения автоматической обработки изображений флуоресцентной активности клеток для дальнейшего установления закономерностей при изменении активности клеток
Михаил
Иванченко
Васильевич
Ведущий научный сотрудник
Доктор физико-математических наук
Доцент
J-7045-2013
6603861723
128430
0000-0002-1903-7423
РОССИЯ
Михаил
Иванченко
Васильевич
Проректор по научной работе
РОССИЯ
28.23.15
Распознавание образов. Обработка изображений
34.15.43
Молекулярная нейробиология
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
03.01.RU
NEUROSCIENCES
03.02.RX
NEUROIMAGING
01.02.EV
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
Михаил
Иванченко
Васильевич
Разработка модуля фильтрации изображений и выделения отдельных астроцитов
РОССИЯ
Михаил
Кривоносов
Игоревич
Написание кода программы
РОССИЯ
Елена
Митрошина
Владимировна
Отладка программы
РОССИЯ
Мария
Ведунова
Валерьевна
Разработка модуля детектирования кальциевого события
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ННГУ им. Н.И. Лобачевского
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского».
1025203733510
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения