Способ прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца на основании данных генетического тестирования
ПРОФИЛАКТИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНА ОЦЕНКА РИСКА ВНЕЗАПНАЯ СЕРДЕЧНАЯ СМЕРТЬ ЭКЗОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ НЕИНФЕКЦИОННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ ОНКОПАТОЛОГИЯ ФАРМАКОГЕНЕТИКА
Изобретение относится к области медицины, а именно кардиологии, и может быть использовано для определения риска развития ишемической болезни сердца (ИБС) на основании данных генетического теста. 
Изобретение позволяет выявлять лиц с повышенным риском развития ИБС при проведении превентивного генетического тестирования с целью постановки их на диспансерный учет и раннего начала профилактических и лечебных мероприятий. Технический результат изобретения – выделение на основании данных генетической диагностики четырех категорий риска развития ИБС, что будет способствовать повышению эффективности прогнозирования риска развития ИБС, особенно у лиц молодого возраста. Поставленная задача решается тем, что в способе прогнозирования риска развития ИБС у лиц на основании 
 анных генетической диагностики методом секвенирования следующего поколения (NGS) выявляется факт наличия редких (с частотой минорного аллея в популяции менее 1%) и низкочастотных (с частотой минорного аллея в популяции от 1% до 5%) ВНП. Далее из всех выявленных в результате генетической диагностики редких и низкочастотных ВНП в генах LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3 и ANGPTL4 отбирают ВНП, которые удовлетворяют следующим двум общим критериям. Затем на основании отобранных по критериям редких и низкочастотных ВНП в генах LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3 и ANGPTL4 осуществляют разделение на две группы: ВНП с повышенным риском ИБС и ВНП со сниженным риском ИБС, и каждый ВНП получает соответствующий риску балл, при этом: к группе редких и низкочастотных ВНП с повышенным риском ИБС относят: все отобранные редкие и низкочастотные ВНП гена LDLR за исключением ВНП rs72658867, и признак оценивают в 4 балла на каждую минорную аллель ВНП гена LDLR; все отобранные редкие и низкочастотные ВНП гена LPL, APOC2 и APOA5, и признак оценивают в 2 балла на каждую минорную аллель ВНП генов LPL, APOC2 и APOA5; редкие и низкочастотные ВНП генов APOB и PCSK9, связанные с развитием семейной гиперхолестеринемии, и признак оценивают в 2 балла на каждую минорную аллель отобранных ВНП генов АРОВ и PCSK9. К группе редких и низкочастотных ВНП со сниженным риском ИБС относят: все отобранные редкие и низкочастотные ВНП генов ANGPTL3 и ANGPTL4, и признак оценивают в (-1) балл на каждую минорную аллель ВНП генов ANGPTL3 и ANGPTL4; редкие и низкочастотные ВНП генов APOB, PCSK9 и APOC3, приводящие к развитию семейной гипобеталипопротеинемии, и признак оценивают в (-1) балл на каждую минорную аллель отобранных ВНП; редкие и низкочастотные ВНП rs11591147 гена PCSK9 и rs72658867 гена LDLR, и признак оценивают в (-0,5) балла на каждую минорную аллель отобранных ВНП. Для учета совместного эффекта нескольких редких и низкочастотных ВНП генов LDLR, APOB, PCSK9, APOC2, APOA5, LPL, ANGPTL3, APOC3, ANGPTL4 у пациента суммируются полученные для каждого аллеля, каждого редкого и низкочастотного ВНП баллы. На основании полученного суммарного балла за редкие и низкочастотные ВНП пациентов делят на 3 основные группы: со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП 2 балла и более - с очень высоким генетическим риском развития ИБС; со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП (-0,5) балла или менее –с  референтным (минимальным относительным риском развития ИБС в данном исследовании) генетическим риском развития ИБС; со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП от 0 до 1,5, для которых дополнительно на основании генетического анализа генотипов 59 частых ВНП рассчитывают значение балла единой шкалы генетического риска для 59 частых ВНП (ШГР59) по формуле. При этом минимальное значение ШГР59 составило (-4,416) балла, максимальное значение ШГР59 (-2,01) балла, а значение для 50 перцентиля ШГР59 (-3,186) балла. После определения ШГР59 за частые ВНП все пациенты со значением балла за редкие и низкочастотные ВНП от 0 до 1,5 делятся дополнительно еще на 2 группы: с высоким генетическим риском развития ИБС, и со значением ШГР59 более (-3,186) балла ((-3,186) - значение для 50 перцентиля ШГР59, экспериментально полученное в группе участников данного исследования); с минимально повышенным генетическим риском развития ИБС, и со значением ШГР59 (-3,186) баллов или менее. На основании полученных результатов делают вывод об очень высоком риске развития ИБС у лиц из группы с очень высоким генетическим риском развития ИБС, высоком риске развития ИБС у лиц из группы с высоким генетическим риском развития ИБС и об относительном низком риске развития ИБС у лиц из групп с минимально повышенным генетическим риском развития ИБС и с референтным генетическим риском развития ИБС. При очень высоком или высоком риске развития ИБС пациента направляют к терапевту или кардиологу для проведения диагностики ИБС, постановки на диспансерный учет и раннего начала профилактических и лечебных мероприятий. При относительном низком риске развития ИБС у пациента, абсолютный риск развития ИБС не равен нулю, и поэтому таким пациентам рекомендуется оценка сердечно-сосудистого риска на основании действующих клинических рекомендаций.
Для собственных нужд НМИЦ ТПМ, а также использования в иных медицинских учреждениях
Алексей
Мешков
Николаевич
Руководитель лаборатории молекулярной генетики
Кандидат медицинских наук
Доцент
K-1056-2017
7005791146
117425
РОССИЯ
Надежда
Учеваткина
Владимировна
руководитель отдела
РОССИЯ
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
76.29.30
Кардиология и ангиология
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
03.02.DQ
CARDIAC & CARDIOVASCULAR SYSTEMS
Анастасия
Жарикова
Александровна
проведение биоинформатического анализа данных: разработка схемы биоинформатического анализа, проведение биоинформатического анализа первичных данных
РОССИЯ
Оксана
Драпкина
Михайловна
общее руководство и планирование работ по созданию изобретения
РОССИЯ
Алексей
Мешков
Николаевич
общее руководство и планировании работ по созданию изобретения, набор и клиническое обследование пациентов, участие в проведении генетической диагностики: создание панели для проведения генетической диагностики прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца, участие в проведении биоинформатического анализа данных, статистический анализ данных, подготовка заявки
РОССИЯ
Анна
Киселева
Витальевна
участие в общем планировании работ по созданию изобретения, участие в проведении генетической диагностики: создание панели для проведения генетической диагностики прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца, оптимизация и проведение пробоподготовки, приготовления ДНК-библиотек (n=2405), секвенирования следующего поколения (NGS), дополнение и рецензирование заявки
РОССИЯ
Александра
Ершова
Игоревна
участие в общем планировании работ по созданию изобретения, набор и клиническое обследование пациентов, участие в проведении генетической диагностики: создание панели для проведения генетической диагностики прогнозирования риска развития ишемической болезни сердца
РОССИЯ
Василий
Раменский
Евгеньевич
проведение биоинформатического анализа данных: разработка схемы биоинформатического анализа, участие в проведении биоинформатического анализа первичных данных (n=2405), создание единого файла содержащего информацию о всех ВНП, дополнение и рецензирование заявки
РОССИЯ
Евгения
Сотникова
Андреевна
участие в проведении генетической диагностики: оптимизация и проведение пробоподготовки, приготовления ДНК-библиотек (n=2405), секвенирования следующего поколения (NGS)
РОССИЯ
Юрий
Вяткин
Викторович
проведение биоинформатического анализа данных: разработка схемы биоинформатического анализа, участие в проведении биоинформатического анализа первичных данных (n=2405), расчет значения ШГР59 для всех пациентов
РОССИЯ
МИНЗДРАВ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1127746460896
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБУ "НМИЦ ТПМ" МИНЗДРАВА РОССИИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ТЕРАПИИ И ПРОФИЛАКТИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЫ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1027739172240
ОКСАНА
ДРАПКИНА
МИХАЙЛОВНА
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения