«Программа для оценки количественных характеристик колоса пшеницы (ОКХК)/ The program for the extraction the quantitative characteristics of the wheat spike (WERecognizer)»
КОМПЬЮТЕРНАЯ ФЕНОМИКА РАСТЕНИЙ, МОРФОМЕТРИЯ КОЛОСА ПШЕНИЦЫ, КОЛИЧЕСТВЕННЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ КОЛОСА ПШЕНИЦЫ, АНАЛИЗ ИЗОБРАЖЕНИЙ
Программа предназначена для решения задач в области компьютерной феномики растений: получения и анализа больших омиксных данных по фенотипическим параметрам колосьев пшеницы. Программа на основе обработки и анализа двумерных цифровых изображений колоса пшеницы позволяет оценить его количественные характеристики: остистость, площадь колоса на изображении, длину, ширину, округлость, вытянутость и другие параметры, характеризующие его форму. Программа может быть использована в области генетики растений для массовой высокопроизводительной обработки феномных данных (компьютерного анализа характеристик формы колоса пшеницы) и последующего использования этих данных вместе с омиксными данными по геномам и транскриптомам пшеницы для изучения взаимосвязи фенотип-генотип.
Программа «WERecognizer» может быть использована в задачах изучения взаимосвязи между генотипом растений и признаками формы и размеров колоса у пшеницы, для задач классификации растений и оценки их продуктивности.
Салина Е.А.
рук. отделения
Доктор биологических наук
Орлова Г.В.
ученый секретарь
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
34.23.57
Генетика возделываемых растений и лесных пород
01.06.DE
PLANT SCIENCES
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Евгений
Комышев
Геннадьевич
Разработка структуры программы, алгоритмов, программирование, тестирование
Михаил
Генаев
Александрович
Разработка архитектуры и алгоритмов, описание программы, программирование
Дмитрий
Афонников
Аркадьевич
Разработка архитектуры и алгоритмов
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения