Программа для статистического анализа представленности данных образцов в файлах секвенирования платформы DNBSEQ-G400 "FQstats G-400"
Высокопроизводительное секвенирование NGS анализ данных секвенирования DNBSEQ
Эта программа проводит анализ соответствия данных высокопроизводительного секвенирования в формате fastq, полученных на приборе DNBSEQ-G400 и таблицы баркодирования образцов для соответствующего рана, генерируемых с помощью ПО для ЭВМ Лабораторная информационная система “O’Gelis”. Программа позволяет оперативно проводить первичный контроль качества данных секвенирования и определяет дополнительную интеграцию ЛИС в платформу для секвенирования, что сокращает время ручного труда при процессировании большого потока образцов. Программа сопоставляет данные, предоставленные ЛИСом и файлы, полученные с секвенатора. Далее, сопоставленные данные о представленности образцов в выходных файлах секвенатора записывается в таблицу.
Программа может применяться пользователями высокопроизводительных секвенаторов DNBSEQ G-400 при каждом запуске прибора для первичного контроля качества данных
Дмитрий
Коростин
Олегович
старший научный сотрудник Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
AAD-9807-2019
34977057500
584897
0000-0003-1343-2550
РОССИЯ
Дмитрий
Шагин
Алексеевич
Проректор по инновационной деятельности
РОССИЯ
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Анна
Павлова
Сергеевна
РОССИЯ
Дмитрий
Коростин
Олегович
РОССИЯ
Роберт
Афасижев
Нурбиевич
РОССИЯ
Борис
Никашин
Алексеевич
РОССИЯ
Анна
Шмитко
Олеговна
РОССИЯ
Вера
Белова
Александровна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО РНИМУ ИМ. Н.И. ПИРОГОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "РОССИЙСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ Н.И. ПИРОГОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1027739054420
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения