«Программа для функционального анализа распределения амилоидогенных участков в протеомах прокариот» (FAR-AS)
АМИЛОД, ESCHERICHIA COLI, БАКТЕРИЯ
К преимуществам данной программы относятся:•Высокопроизводительное аннотирование амилоидогенных участков с помощью алгоритма SARP•Гибкий подход к поиску связей со структурными и функциональными элементами белков•Возможность проведения анализа как у отдельных протеомов, так и в рамках целых таксономических группОсновные технические характеристики:Язык программирования: GoПрограммное обеспечение – (35 Мбайт)Примечание:При создании программы: 1. Использовалась стандартная библиотека языка Go (распространяется по стандартной лицензии BSD license на сайте https://golang.org/)2.  Аннотирование амилоидогенных участков осуществлялось с помощью алгоритма SARP, распространение которого осуществляется по запросу без ограничений (Antonets K.S., Nizhnikov A.A. SARP: A Novel Algorithm to Assess Compositional Biases in Protein Sequences. // Evol Bioinform Online. 2013, Т. 9, С. 263-73. doi: 10.4137/EBO.S12299).
Программа FAR-AS предназначена для высокопроизводительного аннотирования амилоидогенных участков в протеомах прокариот и поиска полнопротеомных связей этих участков со структурно или функционально значимыми элементами белков.
Нижников А.А.
Доцент
Кандидат биологических наук
Лебедева Е.В.
Начальник Управления научных исследований
34.15.23
Молекулярная генетика
01.06.CQ
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Антон
Нижников
Александрович
40%
Кирилл
Антонец
Сергеевич
60%
Минобрнауки России
Министерство образования и науки Российской Федерации
1047796287440
Организация
Министерство образования и науки Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
1037800006089
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения