Программа численного сравнения моделей геномной селекции растений
геномная селекция регрессия бустинг
Программа предназначена для проведения кросс-валидации и проверки моделей лучшей линейной несмещенной оценки (ЛЛНО, англ. BLUP), построенной методом гребневой регрессии и байесовской оптимизации, а также моделей экстремального градиента бустинга.
Основные функции включают разбиение датасета на  обучающую, валидационную и тестовую выборки, проведение заданного числа циклов обучения и валидации, сравнение оценок точности построенных моделей на обучающей и валидационной выборках по критерию Манна-Уинти-Уилкоксона, определения и сохранения лучшей модели, вычисление точности на тестовых данных. Программа позволяет учитывать в модели структуру популяции в виде матрицы родства или ковариационной матрицы.
Программа написана на языке программирования R скрипт для системы статистических расчетов R, версии не ниже 4.0, имеет интерфейс командной строки. Программа может быть запущена на персональных компьютерах, рабочих станциях или серверах на основе процессоров Интел или АМД с частотой не ниже 1 ГГц и объемом оперативной памяти не меньше 16 Гб под управлением операционных систем MS Windows, GNU/Linux или macOS поддерживаемых производителями версий.
Программа может быть использована для научных исследований по селекции растений, анализу данных в биоинформатике и образовательном процессе.
Алексей
Боровков
Иванович
Проректор по цифровой трансформации
Кандидат технических наук
Доцент
G-3055-2011
840090300
6567
РОССИЯ
Виталий
Сергеев
Владимирович
Первый проректор
РОССИЯ
34.31.27
Рост и развитие растений
27.35.43
Математические модели биологии
01.06.HY
DEVELOPMENTAL BIOLOGY
Константин
Козлов
Николаевич
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО СПБПУ,СПБПУ,ФГАОУ ВО "СПБПУ", САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ПОЛИТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ПЕТРА ВЕЛИКОГО
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ПОЛИТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ПЕТРА ВЕЛИКОГО"
1027802505279
АНДРЕЙ
РУДСКОЙ
ИВАНОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения