Приложение для формирования списка мотивов нуклеотидных последовательностей с целью разработки ДНК-зондов
алгоритм Нидлмана-Вунша мотив НК-последовательности ДНК-зонды
Программа предназначена для формирования списка мотивов нуклеотидных последовательностей с целью разработки ДНК-зондов. 
На первом этапе анализ проводится посредством построения точечной матрицы гомологий с помощью алгоритма Нидлмана-Вунша, при этом высокая детализация результирующей матрицы достигается посредством разбиения её на фрагменты, подлежащие дальнейшему анализу. Формируется список мотивов, потенциально перспективных участков ДНК, показывающих значительную (задаваемую пользователем) взаимную гомологию. 
На втором этапе проводится гибридизация in silico отобранных фрагментов с целью уточнения их размеров и локализации. Формируется список мотивов, являющийся предварительным списком потенциально перспективных ДНК-зондов.
Конструирование ДНК-зондов
Поиск конкретных генов бактерий в почве, воде и др. средах
Поиск бактерий-продуцентов НРПС
Татьяна
Минкина
Михайловна
Заведующий кафедрой почвоведения и оценки земельных ресурсов
Доктор биологических наук
Профессор
AAC-3561-2020
15063165400
orcid.org/0000-0003-3022-0883
РОССИЯ
Анатолий
Метелица
Викторович
Проректор по научной и исследовательской деятельности
РОССИЯ
34.27.51
Бактерийные препараты
34.27.21
Генетика и селекция микроорганизмов
34.23.05
Методы и аппаратура в генетике
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Мария
Мазанко
Сергеевна
Формализация задачи
РОССИЯ
Юрий
Денисенко
Викторович
Написание исходного текста программы
РОССИЯ
Евгения
Празднова
Валерьевна
Формализация задачи
РОССИЯ
Анжелика
Брень
Борисовна
Разработка спецификации программы
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
Южный федеральный университет,  ФГАОУ ВО "ЮФУ"
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет"
1026103165241
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Общества с ограниченной ответственностью