Программа для реализации серверной части инструмента HiCT на Java для интерактивной визуализации, ручного скаффолдинга и валидации геномных сборок по данным Hi-C
геномная сборка геном геномные данные
Серверная часть инструмента HiCT предназначена для интерактивной визуализации, ручного скаффолдинга и валидации геномных сборок по данным Hi-C. Программа используется в биоинформатике и геномике для обработки и анализа геномных данных. Основные функции включают выполнение операций скаффолдинга и построение Hi-C карт с использованием REST API для взаимодействия с веб-интерфейсом. Реализация на Java улучшает многопоточность и устраняет проблемы, связанные с GIL в Python. Структура кода организована в виде классов, каждый из которых отвечает за отдельные функциональные части и логически связанные механизмы инструмента.
Программа используется в биоинформатике и геномике для обработки и анализа геномных данных.
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
Антон
Замятин
Андреевич
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"-"
"-"
РОССИЯ
Александр
Сердюков
Николаевич
"Отсутствует"
"Отсутствует"
РОССИЯ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИТМО"
1027806868154
ВЛАДИМИР
ВАСИЛЬЕВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИТМО"
1027806868154
ВЛАДИМИР
ВАСИЛЬЕВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения