Плагин для программы ImageJ для подсчета флуоресцентных меток на микрофотографиях
флуоресцентная метка, микрофотографии, автоматический анализ
Плагин позволяет с помощью программы ImageJ, а также ее клонов FIJI и др. выполнять пакетный анализ микрофотографий клеточных культур, полученных с помощью световой, флуоресцентной или фазово-контрастной микроскопии, расположенных в одном директории. Плагин имеет диалоговый интерфейс. Плагин имеет возможности выбора рабочего директория, выбора одного из двух алгоритмов обработки (CELLS or NUCLEUS, LABELES) и без анализа (NONE), в каждом из цветовых каналов (RED, GREEN, BLUE) с указанием характерного размера элемента в пикселях, а также генерирует маску для проанализированного изображения в виде файла jpeg. В результате работы создается сводный отчет по проанализированным изображениям с указанием числа и размера частиц, а также дополнительной статистики.
Лечебные учреждения любого типа. Отделения клинической лабораторной диагностики, гистологии и морфологии
Салмин В.В.
Зав. кафедрой медицинской и биологической физики
Доктор физико-математических наук
Протопопов А.В.
И.о. ректора
76.29.39
Хирургия
76.29.49
Онкология
76.29.43
Урология
03.02.DM
ONCOLOGY
03.02.YA
SURGERY
03.02.ZA
UROLOGY & NEPHROLOGY
Алла
Салмина
Борисовна
Постановка задачи. Обоснование методики анализа данных
Андрей
Моргун
Васильевич
Разработка интерфейса, тестирование и апробация программы.
Владимир
Салмин
Валерьевич
Разработка кода программы, отладка, разработка интерфейса
МИНЗДРАВ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1127746460896
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБОУ ВО КрасГМУ им. проф. В.Ф.Войно-Ясенецкого Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф.Войно-Ясенецкого" Министерства здравоохранения Российской Федерации
1022402471992
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения