Программа для подбора сетов адаптеров с баркодами для платформ MGISEQ “BС-store” для ПК на ОС Windows
секвенирование генома секвенирование экзома высокопроизводительное секвенирование bc-store баркодирование библиотек ДНК адаптеры MGISEQ
Программа представляет собой десктопное приложение, предназначенное для анализа набора баркодов на возможность одновременного использования при секвенировании, а также дополнения текущего набора баркодов до нужного количества для секвенаторов компании MGI. Пользователю предлагается вводить данные, что позволяет самостоятельно задавать исследуемый набор баркодов, их концентрации и критерий, для опции добора баркодов — их количество и список из каких баркодов выбирать. Программа предоставляет пользователю отчет, представляющий собой анализ введенного набора баркодов в рамках выбранного критерия в виде информационного текста и графиков, иллюстрирующих совместимость сета. Для добора баркодов также предоставляется список баркодов, дополняющих сет или сообщение об отсутствии таковых.
Для параллельного секвенирования образцов требуется присвоение уникального баркода или сочетания баркодов каждому образцу. Баркоды должны быть совместимы. Программа представляет собой десктопное приложение, предназначенное для анализа набора баркодов на возможность одновременного использования при секвенировании, а также дополнения текущего набора баркодов до нужного количества для секвенаторов компании MGI.
Дмитрий
Коростин
Олегович
Старший научный сотрудник
Отсутствует
Старший научный сотрудник
AAD-9807-2019
34977057500
584897
0000-0003-1343-2550
РОССИЯ
Денис
Ребриков
Владимирович
Проректор по научной работе
РОССИЯ
76.03.33
Медицинская цитология
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
01.06.DR
CELL BIOLOGY
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Вера
Белова
Александровна
Тестирование программы
РОССИЯ
Ирина
Булушева
Алексеевна
Разработка алгоритма, программная реализация в виде приложения, тестирование программы
РОССИЯ
Дмитрий
Коростин
Олегович
Формулировка технического задания
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО РНИМУ ИМ. Н.И. ПИРОГОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "РОССИЙСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ Н.И. ПИРОГОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1027739054420
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения