«База данных для выявления нитрат-регулируемых генов у гороха» (Peanitrate)
нитрат экспрессия генов горох транскриптомный анализ
База данных предназначена для выявления нитрат-регулируемых генов у гороха. В базе собраны гены, экспрессия которых значимо увеличивается или значимо снижается в корнях гороха (сорт Frisson) при добавлении нитрата в питательную среду. Данные о каждом гене включают в себя следующие характеристики: Идентификатор гена в соответствии с номенклатурой INRA, нормализованные числа прочтений, выровнявшихся на данный ген, на пробу, среднее число прочтений, выровнявшихся на данный ген, на пробу, логарифм по основанию 2 к отношению среднего числа прочтений, выровнявшихся на данный ген в образцах корней после обработки нитратом, к среднему числу прочтений, выровнявшихся на данный ген в контрольных образцах без воздействия нитрата, стандартная ошибка предыдущего показателя, статистика Вальда, p-уровень значимости различий между опытными и контрольными пробами, p-уровень значимости различий между опытными и контрольными пробами с учетом поправки Беньямини-Хохберга на множественные сравнения, идентификатор гена, аннотация гена.
База данных может быть использована для построения модели регуляции ответа на нитрат у гороха посевного и других бобовых растений, для разработки систем для оценки азотного статуса бобовых растений на основании уровней экспрессии маркерных генов. База может быть использована  академическими, отраслевыми институтами, в которых ведутся работы по изучению действия минеральных азот-содержащих удобрений на рост и развитие гороха и других бобовых растений, а также занимающиеся проблемами симбиотической азотфиксации, вузы, реализующие биоинформатические исследования и/или реализующие соответствующие образовательные программы
68.03.03
Биология сельскохозяйственных растений
Мария
Ганчева
Семеновна
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"AAB-7157-2020"
"56336247600"
"3694-4470"
"https://www.researchgate.net/profile/Maria-Gancheva"
"0000-0002-9631-6143"
РОССИЯ
Людмила
Лутова
Алексеевна
"Доктор биологических наук"
"Профессор"
"N-6386-2013"
"6603722721"
"3685-7136"
"0000-0001-6125-0757"
РОССИЯ
Мария
Лебедева
Александровна
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"C-6386-2013"
"24734307600, 56612261700"
"6000-6307"
"0000-0002-6412-7401"
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1037800006089
НИКОЛАЙ
КРОПАЧЕВ
МИХАЙЛОВИЧ
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения