Нуклеотидные последовательности генома норовирусов (NoroGen), версия 2.0
Norovirus complete genome Norovirus геном вирусный изолят полные нуклеотидные последовательности норовирус
База данных (БД) содержит полные нуклеотидные последовательности (НП) генома норовирусов (семейство Caliciviridae, род Norovirus), а также частичные последовательности генома норовирусов, выявленных на территории Российской Федерации (РФ), извлечённые из базы данных GenBank (NCBI, США) по ключевым словам «Norovirus complete genome» и по фамилиям отечественных авторов, осуществивших депонирование в GenBank, по состоянию на 02.06.2021, ранжированные по номеру доступа в GenBank, охарактеризованные по типу и субтипу двух открытых рамок считывания. Имеются также данные о хозяине вируса, длине нуклеотидной последовательности, стране и дате получения вирусного изолята, дате отправки последовательностей для регистрации и реализации в GenBank, ссылки на статьи в PubMed, в которых опубликованы представленные НП. БД позволяет формировать выборки последовательностей для сравнительного анализа с помощью компьютерных программ, анализировать пространственно-временные особенности циркуляции генетических вариантов норовирусов. Экспорт материала осуществляется в формате FASTA, а также в виде таблиц в формате XLS, графиков и диаграмм в формате PNG, JPEG, PDF. Область применения базы данных: молекулярно-генетический мониторинг циркуляции норовирусов в рамках эпидемиологического надзора за норовирусной инфекцией, изучение молекулярной эволюции эпидемических вариантов норовирусов. Наличие в БД полногеномных последовательностей позволяет использовать её для сравнительного анализа любых участков генома вновь выявленных норовирусов, для установления их возможных генетических взаимосвязей, времени и страны происхождения их эволюционных предшественников. Дополнение базы данными о российских НП позволяет систематизировать и анализировать информацию о циркуляции норовирусов в различных регионах РФ.
Молекулярно-генетический мониторинг циркуляции норовирусов в рамках эпидемиологического надзора за норовирусной инфекцией, изучение молекулярной эволюции эпидемических вариантов норовирусов, сравнительный анализ любых участков генома вновь выявленных норовирусов, для установления их возможных генетических взаимосвязей, времени и страны происхождения их эволюционных предшественников, систематизация и анализ информации о циркуляции норовирусов в различных регионах РФ
Надежда
Новикова
Алексеевна
зав.лабораторией
Доктор биологических наук
Профессор
S-4201-2017
57196902246
182455
https://publons.com/researcher/2024236/nadejda-a-novikova/
0000-0002-3710-6648
РОССИЯ
Наталья
Зайцева
Николаевна
директор
РОССИЯ
34.15.31
Молекулярная биология вирусов
34.25.39
Вопросы экологии и эпидемиология вирусов
76.29.50
Инфекционные болезни
01.06.ZE
VIROLOGY
03.03.NN
INFECTIOUS DISEASES
Наталия
Епифанова
Владимировна
РОССИЯ
Владимир
Епифанов
Юрьевич
РОССИЯ
Роспотребнадзор
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1047796261512
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные казенные учреждения
ФБУН ННИИЭМ ИМ.АКАДЕМИКА И.Н.БЛОХИНОЙ РОСПОТРЕБНАДЗОРА
ФЕДЕРАЛЬНОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "НИЖЕГОРОДСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ ИМ.АКАДЕМИКА И.Н.БЛОХИНОЙ" ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
1025203013890
НАТАЛЬЯ
ЗАЙЦЕВА
НИКОЛАЕВНА
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные бюджетные учреждения