Способ выявления гена холодового шока csh1 у штаммов Vibrio choleraе с помощью ПЦР в режиме реального времени
ХОЛЕРНЫЕ ВИБРИОНЫ ХОЛЕРА ПЦР VIBRIO CHOLERAE ГЕН ХОЛОДОВОГО ШОКА
Изобретение относится к области биотехнологии. Представлен способ выявления гена холодового шока csh1 у штаммов Vibrio cholerae с помощью ПЦР, включающий выделение ДНК из исследуемого штамма, постановку ПЦР со специфическими праймерами CSh 1 и CSh с последующим учетом реакции амплификации. При этом в инкубационную смесь вносят 0,5 мкл интеркалирующего красителя SYBR Green I для выявления продуктов амплификации с последующим плавлением образовавшихся ампликонов, а по их температуре плавления, в диапазоне 72-94°С и по динамике изменения показателя флюоресценции по каналу FAM амплификатора, проводят учет результатов по геометрическому методу путем регистрации показателя Ср. При наличии целевого продукта - гена холодового шока cshl - формируется амплификон с низким Ср, а при отсутствии специфической мишени реакция с парой праймеров CSh 1- CSh 2 образует другие амплификоны с высоким Ср. Изобретение позволяет использовать его в лабораторной диагностике при проведении мониторинга холеры и проведении исследований, связанных с изучением особенностей биологии возбудителя, включающего идентификацию генетических структур, обеспечивающих адаптацию холеры к неблагоприятным факторам внешней среды.
Использование предполагаемого изобретения позволяет достоверно, просто и быстро с помощью ПЦР в формате реального времени и последующего плавления ампликонов выявлять у штаммов  Vibrio cholerae O1 ген холодового шока csh1. Это крайне важно при проведении мониторинга холеры и исследований роли гена холодового шока csh1 O1 Vibrio cholerae в обеспечении персистенции вибрионов в условиях низких температур, характерных для регионов Российской Федерации.
Сергей
Водопьянов
Олегович
Главный научный сотрудник
Доктор медицинских наук
Отсутствует
-
6701686549
289536
https://orcid.org/0000-0003-4336-0439
0000-0003-4336-0439
РОССИЯ
Алексей
Носков
Кимович
Директор
РОССИЯ
34.27.15
Систематика и номенклатура микроорганизмов
34.27.29
Биология возбудителей заболеваний человека и животных
34.27.59
Эпидемиология микроорганизмов
34.27.21
Генетика и селекция микроорганизмов
34.27.05
Методы и аппаратура в микробиологии
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Оксана
Бородина
Васильевна
20 %
РОССИЯ
Алексей
Водопьянов
Сергеевич
30 %
РОССИЯ
Игорь
Олейников
Павлович
10 %
РОССИЯ
Сергей
Водопьянов
Олегович
40 %
РОССИЯ
Роспотребнадзор
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1047796261512
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные казенные учреждения
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Федеральное казённое учреждение здравоохранения "Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1026103278959
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные бюджетные учреждения