Способ получения полностью разрешенных структур белков с помощью частичных структурных данных и компьютерного моделирования для разработки препаратов, нацеленных на трансглутаминазу
Лиганд Молекулярный докинг Структура высокого разрешения Моделирование Трансглутаминаза
Разработан способ получения полностью разрешённой структуры целевой конформации белка трансглутаминазы на основе частично разрешённой структуры этой конформации для использования в разработке лекарств на основе структуры белка, состоящий в предсказании белковых структур с помощью программы AlphaFold с частично разрешённой структурой в качестве пользовательского шаблона, множественным выравниванием аминокислотных последовательностей, схожих с целевой аминокислотной последовательностью, и заменой аминокислотных остатков активного сайта в последовательности на аланины, начиная с первого, входящего в сайт связывания, и заканчивая последним, входящим в сайт связывания. Способ контроля точности предсказанной структуры целевого белка включает метод молекулярного докинга лиганда с известной позицией в сайте связывания с помощью программы Gnina.
Результат может быть использован в биотехнологии и медицине для разработки методом "от структуры" (structure-based drug design) новых препаратов, связывающихся с белками-мишенями.
34.17.03
Теоретическая и математическая биофизика
Алексей
Власов
Валерьевич
"Кандидат физико-математических наук"
"Отсутствует"
"L-5998-2014"
"57040626500"
"822007"
"0000-0001-9218-0464"
РОССИЯ
Илья
Манухов
Владимирович
"Доктор биологических наук"
"Отсутствует"
"L-1375-2014"
"14122024500"
"0000-0001-8646-7207"
РОССИЯ
Андрей
Кессених
Григорьевич
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"abf-3614-2020"
"57214141449"
""
""
РОССИЯ
Сергей
Иващенко
Даниилович
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"57343213700"
"отсутствует"
""
"0000-0002-6438-9153"
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "РОССИЙСКИЙ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ (РОСБИОТЕХ)"
1037739533699
АЛЕКСАНДР
СОЛДАТОВ
АНАТОЛЬЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения