База данных спейсерных последовательностей и бактериофагов, выявленных через расшифрованные спейсерные структуры CRISPR/ Cas систем штаммов Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae CRISPR/ Cas система спейсерные последовательности бактериофаги
База данных предназначена для структурированного хранения данных о 211 бактериофагах, выявленных через нуклеотидные последовательности 1467 спейсеров, расположенных в CRISPR-локусах 250 штаммов Klebsiella pneumoniae, их систематизации и поиска.  Данные для 231 штамма получены из базы данных NCBI; для 19 штаммов спейсерные последовательности определены при секвенировании ПЦР продукта, полученного из клинических изолятов Klebsiella pneumoniae. База данных включает: общую характеристику штаммов (номер штамма в NCBI; название; серотип; место, источник и год выделения); место локализации CRISPR-локусов (хромосома, плазмида);  реестр спейсеров, входящих в состав CRISPR-кассет хромосом и плазмид; реестр бактериофагов, содержащих в геноме гомологичные спейсерам последовательности. Также в базу включена информационная система для быстрого получения репрезентативных данных о наличии конкретных спейсеров в CRISPR-кассетах хромосом и плазмид  штаммов Klebsiella pneumoniae и о бактериофагах,  выявленных через спейсерные последовательности их CRISPR- структур. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 22-25-00449, https://rscf.ru/project/22-25-00449/.
База данных может быть использована учеными и исследователями в области медицины и биотехнологии, а также в преподавательской деятельности ВУЗов и колледжей медико-биологического профиля.
Лилия
Степаненко
Александровна
Старший научный сотрудник
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
Q-4363-2017
57190748950
550176
0000-0002-5792-7283
РОССИЯ
Игорь
Малов
Владимирович
Ректор
РОССИЯ
62.61.99
Другие проблемы биотехнологии и нанотехнологии в медицине
76.03.41
Медицинская вирусология
76.03.43
Медицинская микробиология
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
03.03.WV
SOCIAL SCIENCES, BIOMEDICAL
Борис
Сухов
Геннадьевич
РОССИЯ
Виктория
Бединская
Владимировна
РОССИЯ
Лилия
Степаненко
Александровна
РОССИЯ
Татьяна
Конькова
Владимировна
РОССИЯ
Андрей
Борисенко
Юрьевич
РОССИЯ
Владимир
Злобин
Игоревич
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ФГБОУ ВО ИГМУ Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Иркутский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации
1023801539673
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения