Программа для определения типа и параметров движения частиц в клетках HeLa
СЕГМЕНТАЦИЯ ТРАЕКТОРИЙ ЦИТОСКЕЛЕТ ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ СИГНАЛИЗАЦИЯ ВЕЗИКУЛЯРНЫЙ ТРАНСПОРТ
Программа предназначена для определения типа и параметров движения частиц в ходе рецептор-опосредованного эндоцитоза эпидермального фактора роста в клетках HеLa путем обработки временных рядов координат частиц в поле наблюдения микроскопа.
Программа использует скрытую марковскую модель с тремя скрытыми состояниями. Два состояния соответствуют диффузионному и направленному типам движения, тогда как последнее состояние отвечает за изменение направления. Параметры модели, такие как вероятности перехода, коэффициент диффузии, скорость, средний угол и его стандартное отклонение определяются максимизацией логарифма функции правдоподобия. Результаты работы программы могут быть получены в виде графиков зависимости типа движения от времени и распределений продолжительности и скорости движения.
Программа «Программа для определения типа и параметров движения частиц в клетках HeLa» может быть использована при изучении сигнальных и транспортных процессов в клетке и в учебных целях.
Мария
Самсонова
Георгиевна
Профессор
Доктор биологических наук
Профессор
Q-7591-2016
7003974330
84846
https://www.spbstu.ru/university/about-the-university/personalities/169050_samsonova_mariya_georgievna
0000-0002-9353-9173
РОССИЯ
Виталий
Сергеев
Владимирович
Первый проректор
РОССИЯ
34.17.03
Теоретическая и математическая биофизика
27.35.43
Математические модели биологии
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
01.02.EV
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
Константин
Козлов
Николаевич
Разработка математической модели, метода решения и программы
РОССИЯ
Мария
Самсонова
Георгиевна
Разработка алгоритма учета изменения направления движения
РОССИЯ
Минобрнауки России
Министерство образования и науки Российской Федерации
1047796287440
Организация
Министерство образования и науки Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО "СПбПУ"
Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого»
1027802505279
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные автономные учреждения