Программа для определения таксономии для вновь секвенированных геномов прокариот (ПроТаксон)
таксономия секвенирование бактериальный геном аннотация геномов
Программа «ПроТаксон» предназначена для построения распределения таксонов для вновь секвенированных геномов прокариот. Программа осуществляет поиск гомологичных последовательностей по базе полных геномов прокариот с помощью алгоритмов Blast, выделяет фрагменты последовательностей, имеющие наибольший уровень сходства и строит  распределение встречаемости таксонов найденных фрагментов последовательностей для самых длинных скаффолдов, покрывающих 50% генома.
Программа может быть использована в области генетики, молекулярной биологии, медицины и биотехнологии.
Елена
Салина Е.А.
Артемовна
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
U-1866-2019
7003403411
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Владимир
Иванисенко
Александрович
Адаптация алгоритмов
РОССИЯ
Павел
Деменков
Сергеевич
Написание кода программы. Тестирование и отладка
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения