VirQuest
метаданные GenBank длина нуклеотидных последовательностей вид вируса создание локальные генетические вирусные базы данных
Программа предназначена для создания локальных генетических вирусных баз данных (БД). БД формируются на основе запроса пользователя, который состоит из указания вида вируса и длины нуклеотидных последовательностей (НП). В основе алгоритма лежит API-запрос, посылаемый в международную базу данных GenBank. Полученный ответ формируется в виде таблиц с метаданными. Опционально пользователь вместе с табличными БД может скачать НП всех обнаруженных записей. Также предусмотрена функция ручного обновления БД с целью их автоматической актуализации. Программа может быть использована при работе в научно-исследовательских лабораториях для мониторинга и актуализации текущего состояния GenBank по интересующим видам вирусов, и, в особенности, при составлении популяционных выборок с целью проведения филогенетических, популяционно-генетических и филогеографических исследований.
Язык программирования: R. Объем программы для ЭВМ: 21,2 КБ
для мониторинга и актуализации текущего состояния GenBank по интересующим видам вирусов;  при составлении популяционных выборок
34.23.41
Экологическая генетика
34.25.39
Вопросы экологии и эпидемиология вирусов
34.25.21
Генетика вирусов
Юрий
Букин
Сергеевич
"Кандидат биологических наук"
"Отсутствует"
"0000-0002-4534-3846"
РОССИЯ
Евгений
Андаев
Иванович
"Доктор медицинских наук"
"Отсутствует"
"ААК-2542-2020"
"6506860276"
"159671"
"https://www.elibrary.ru/author_profile.asp?id=159671"
"0000-0002-6612-479Х"
РОССИЯ
Артем
Бондарюк
Николаевич
"Отсутствует"
"Отсутствует"
"ААК-2487-2020"
"57200188775"
"800949"
"https://elibrary.ru/author_profile.asp?id=800949"
"0000-0003-4422-0497"
РОССИЯ
Роспотребнадзор
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1047796261512
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные казенные учреждения
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Федеральное казённое учреждение здравоохранения "Иркутский ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1023801543017
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Учреждения