«Программа для определения сходных аминокислотных последовательностей при молекулярной мимикрии» (Alignmentaj)
молекулярная мимикрия аутоиммунные заболевания
Программа предназначена для выявления сходных пентапептидов в молекулярной мимикрии. С ее помощью можно выравнивать два разных белка в разных организмах (например, шиповидный белок (UniProt ID = P0DTC2) SARS-CoV-2 и человеческий аутоантиген тиреоглобулин (UniProt ID = P01266)). В результате программа выявляет аналогичные пентапептиды в белках, что позволяет применяеть ее в медицинских научных и клинических исследованиях для определения молекулярной мимикрии при аутоиммунных заболеваниях и при производстве вакцин.
Программа обеспечивает выполнение следующих функций:
Ввод данных двумя файлами аминокислотной последовательности в фаста формате, произведение расчетов с использованием алгоритма локального выравнивания и вывод полученных результатов.
Кроме использования программы в исследованиях в рамках Гранта РНФ «Иммунонейроэндокринные звенья патогенеза COVID-19 и пост-ковидного синдрома», возможно ее распространение 
заинтересованым медико-биологическим научным группам, которые участвует в разработке безопасных вакцин и исследуют механизмы молекулярной мимикрии.
(Стоимость аналогичных программ составляет около 1 000 долларов США).
Леонид
Чурилов
Павлович
Доцент
Кандидат медицинских наук
Доцент
B-1557-2009
6602953641
8879-0875
https://med.spbu.ru/prepodavateli/405-churilov-leonid-pavlovich.html
0000-0001-6359-0026
РОССИЯ
Елена
Лебедева
Витальевна
Начальник Управления научных исследований
РОССИЯ
76.03.55
Медицинская иммунология
01.06.CQ
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
03.01.NI
IMMUNOLOGY
Владимир
Пахомов
Анатольевич
РОССИЯ
Муслимбек
Норматов
Гуломович
ТАДЖИКИСТАН
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1037800006089
НИКОЛАЙ
КРОПАЧЕВ
МИХАЙЛОВИЧ
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения