Программа для сравнительного анализа профилей дифференциальной экспрессии генов (ИнтерТрансВьюер) / The program for the comparative analysis of differential gene expression profiles (InterTransViewer)
Биоинформатика метаанализ транскриптом экспрессия генов
Программа включает в себя набор инструментов для интеграции, сравнительного анализа и визуализации профилей дифференциальной экспрессии генов. Базовые функции включают получение, объединение и пересечение списков дифференциально-экспрессирующихся генов (ДЭГ); построение диаграмм; выделение ДЭГ, уникальных для отдельного профиля. Дополнительно программа позволяет строить тепловые карты на основе метрик сходства списков ДЭГ, проводить иерархическую кластеризацию профилей транскрипционного ответа и оценивать методом бутстрэп статистическую значимость различия количества ДЭГ в списках, полученных путем объединения множеств ДЭГ в различных условиях.
Программа может быть использована в биоинформатических исследованиях регуляции экспрессии генов, включающих анализ множества наборов данных дифференциальной экспрессии генов, полученных в различных экспериментальных условиях.
Николай
Колчанов
Александрович
научный руководитель
Доктор биологических наук
Академик
A-9916-2014
35444766700
9095-7952
http://assa.bionet.nsc.ru/open/person/355/
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Александр
Тяпкин
Вячеславович
РОССИЯ
Елена
Землянская
Васильевна
РОССИЯ
Александра
Сидоренко
Дмитриевна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦИГ СО РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1025403657410
АЛЕКСЕЙ
КОЧЕТОВ
ВЛАДИМИРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения