YERSINIA PESTIS ANALYZER- ПРОГРАММА ДЛЯ АНАЛИЗА РЕЗУЛЬТАТОВ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ШТАММОВ YERSINIA PESTIS, ОПРЕДЕЛЕНИЯ НАЛИЧИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ РАЗЛИЧНЫХ ГЕНОВ И ВЫЯВЛЕНИЯ INDEL-МАРКЕРОВ
YERSINIA PESTIS INDEL-МАРКЕРЫ ГЕН СЕКВЕНИРОВАНИЕ
Разработанная программа позволяет проводить анализ данных секвенирования штаммов возбудителя чумы. В основе метода лежит поиск заранее определенных референсных генов и нуклеотидных последовательностей в полных или неполных геномах штаммов Yersinia pestis. Проведенный анализ дает возможность определять вид микроорганизма, биовариант анализируемого штамма (подвид, биовар). Полученные данные можно использовать для внутривидового типирования, применяя различные способы генетической дифференциации штаммов (INDEL-типирование, типирование по набору генов, отвечающих за патогенность, определение плазмидного состава). Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК. ОС: Windows/10/ХР/Vista/7, Linux.
Полученные данные можно использовать для внутривидового типирования, применяя различные способы генетической дифференциации штаммов.
Алексей
Трухачев
Леонидович
Ведущий научный сотрудник
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
AAF-9027-2020
57194072037
619647
https://orcid.org/0000-0002-3531-1146
0000-0002-3531-1146
РОССИЯ
Алексей
Носков
Кимович
Директор
РОССИЯ
34.27.29
Биология возбудителей заболеваний человека и животных
34.27.21
Генетика и селекция микроорганизмов
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Алексей
Водопьянов
Сергеевич
20 %
РОССИЯ
Виолетта
Рыкова
Александровна
10 %
РОССИЯ
Алексей
Трухачев
Леонидович
35 %
РОССИЯ
Ольга
Подладчикова
Николаевна
15 %
РОССИЯ
Мисак
Мелоян
Геворгович
10 %
РОССИЯ
Дарья
Кузнецова
Александровна
10 %
РОССИЯ
Роспотребнадзор
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1047796261512
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные казенные учреждения
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Федеральное казённое учреждение здравоохранения "Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
1026103278959
Организация
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Федеральные государственные бюджетные учреждения