Программа для объединения и выравнивания нуклеотидных последовательностей NucleoCom
виртуальная лаборатория обработка и анализ данных биоразнообразие биоклиматическое моделирование цифровая инвентаризация биоты Алтая система обработки больших объемов данных машинное обучение искусственный интеллект
Программа предназначена для объединения различных фрагментов нуклеотидных последовательностей (молекулярных маркеров) для операционных таксономических единиц (OTU) из пересекающихся списков в единый файл с последующим выравниванием по алгоритму MAFFT. С помощью программы решается проблема автоматизации рутинных операций объединения последовательностей с различными наименованиями одних и тех же OTU для разных молекулярных маркеров, а также оперативное изменение состава OTU и молекулярных маркеров в результирующем файле. Входные файлы: файл csv-формата с названиями последовательностей, fasta-файлы, содержащие последовательности. Выходной файл содержит объединенные последовательности (могут быть выравнены по запросу пользователя). Тип ЭВМ: IBM PC - совмест. ПК; ОС: Windows 8-11.
Основными пользователями программы являются биологи и экологи, сотрудники заповедников, осуществляющие мониторинговые исследования популяций.
Любовь
Хворова
Анатольевна
Доцент кафедры теоретической кибернетики и прикладной математики
Кандидат технических наук
Доцент
-
57200211707
63901
https://www.asu.ru/univer_about/personalities/334/
0000-0001-9034-2044
РОССИЯ
Сергей
Бочаров
Николаевич
Ректор
РОССИЯ
20.53.19
Средства обработки и поиска информации
01.02.EV
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
Ольга
Кротова
Сергеевна
РОССИЯ
Евгений
Давыдов
Александрович
РОССИЯ
Юлия
Стрельцова
Сергеевна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБОУ ВО "АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ",АЛТГУ,АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "АЛТАЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
1022201770106
СЕРГЕЙ
БОЧАРОВ
НИКОЛАЕВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения