Программа для получения и парсинга genbank файлов из базы данных NCBI
Парсер genbank аннотация
ParserGB - программа для получения genbank файлов из базы данных NCBI, с возможностью парсинга полей мета данных и представления их в табличном виде. Genbank файл представляет из себя текстовый файл, содержащий как правило нуклеотидную или аминокислотную последовательность, ее аннотацию и мета информация об авторах и изучаемом объекте. На вход программе подается один или несколько идентификаторов последовательностей в базе данных GenBank NCBI. На выходе пользователь получает табличный файл, содержащий идентификаторы последовательностей и их мета данные, например: список авторов, название изучаемого организма, место сбора, координаты сбора и другие характеристики, которые указаны в genbank файле.
Создание генетических баз данных
Максим
Патрушев
Владимирович
Заместитель руководителя Комплекса по научной работе
Кандидат биологических наук
Отсутствует
-
-
-
-
РОССИЯ
Сергей
Гиенко
Юрьевич
Начальник управления
РОССИЯ
34.03.21
Таксономия и номенклатура в биологии
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Федор
Шарко
Сергеевич
100%
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
НИЦ "Курчатовский институт"
федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
1027739576006
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения