Способ диагностирования рака молочной железы на ранних стадиях и прогнозирования лимфогенного метастазирования на основе анализа метилирования наборов генов микроРНК в резекционном или биопсийном материале ткани молочной железы
МС-ПЦР микроРНК гены метилирование рак молочной железы
Разработана технология диагностирования рака молочной железы, включая ранние клинические (I, II) стадии, и прогнозирования лимфогенного метастазирования, которая осуществляется на основе анализа метилирования наборов из генов микроРНК в биопсийном или резекционном материале, полученном из обнаруженного новообразования в молочной железе неизвестной степени злокачественности. В процессе разработки в 2020 г. применена обучающая выборка из 91 парных (опухоль/норма) образцов рака молочной железы (РМЖ), включающая 59 образцов больных на I и II клинических стадиях. В 2021-2022гг применена независимая расширенная экзаменационная выборка из 120 парных образцов РМЖ, включающая 77 парных образцов больных РМЖ на ранних (I-II) клинических стадиях, и в качестве абсолютного контроля - 20 образцов ткани молочной железы от «доноров» (умерших от неонкологического заболевания). Методом количественной МС-ПЦР проводится сравнительный анализ метилирования генов микроРНК в образце ДНК, выделенной из биопсийного или резекционного материала. Методом ROC-анализа оптимизирована комбинация маркеров, которая включает 7 генов микроРНК (MIR124-1, MIR124-2, MIR124-3, MIR125B-1, MIR127, MIR129-2, MIR375) и позволяет диагностировать заболевание РМЖ на ранних I-II клинических стадиях при выявлении метилирования двух или более маркеров из этого набора (критерий >0,1429) с высокой специфичностью 94,12% и чувствительностью 93,42 при AUC=0,958. 
На экзаменационной выборке из 120 образцов опухолей, включающей 71 образец РМЖ с метастазами и 49 образцов без метастазов, установлена высоко значимая (р≤0.001, FDR=0.01) связь повышения уровня метилирования 7 генов микроРНК (MIR124-3, MIR125B-1, MIR127, MIR137, MIR9-3, MIR1258, MIR339) с метастазированием рака в лимфатические узлы. Методом ROC-анализа оптимизирована комбинация маркеров, которая включает 6 генов микроРНК (MIR124-3, MIR125B1, MIR127, MIR1258, MIR339, MIR9-3) и позволяет прогнозировать метастазирование РМЖ при выявлении в ДНК резекционного или биопсийного материала пациента метилирования не менее трех маркеров из шести (критерий > 0.333) с высокой специфичностью 76.5%, чувствительностью 86.9% и величиной AUC=0.894.
Выполняться может совместно врачом хирургом и врачом-генетиком.
Технология относится к лабораторной диагностике и предназначена для научно-практических онкологических центров, а также медицинских учреждений, для научных лабораторий и врачей патофизиологов с возможным использованием в практической диагностике и при скрининговом обследовании.
Элеонора
Брага
Александровна
г.н.с., и.о. зав. лабораторией
Доктор биологических наук
Профессор
P-5574-2016
7005783806
81009
0000-0001-5188-4094
РОССИЯ
Сергей
Морозов
Георгиевич
Директор
РОССИЯ
76.03.53
Патологическая физиология
03.01.TM
PATHOLOGY
Виталий
Логинов
Игоревич
РОССИЯ
Светлана
Лукина
Сергеевна
РОССИЯ
Элеонора
Брага
Александровна
РОССИЯ
Ирина
Пронина
Валерьевна
РОССИЯ
Алексей
Бурденный
Михайлович
РОССИЯ
Елена
Филиппова
Александровна
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБНУ "НИИОПП"
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии"
1037700256880
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения