Способ и набор праймеров для видоспецифической идентификации возбудителей бактериальной пневмонии человека
ДНК анализ ДНК ПЦР биочипы лаборатория на чипе
Изобретение относится к молекулярной биологии, микробиологии и медицине и обеспечивает видоспецифическую идентификацию шести основных возбудителей бактериальной пневмонии человека.
Инфекционная пневмония – острый воспалительный процесс легочной ткани, вызываемый широким рядом возбудителей бактериальной, вирусной и грибковой природы. Вспышки инфекционных пневмоний, вызванных коронавирусами SARS-CoV (2002-2003 г), MERS-CoV (2012-2013 г), SARS-CoV-2 (2019-?), вирусами гриппа А и В, а также бактериальных пневмоний, становятся реальной социальной угрозой. Бактериальные пневмонии характеризуются летальностью около 15%, при этом летальность в случаях тяжелого течения внебольничной пневмонии (ТВП) может достигать 21 - 58%, что сравнимо с таковыми показателями SARS (т.н. атипичная пневмония, ТОРС), MERS и превышает этот показатель для CoViD-19 и гриппа.
Специализированные лечебные учреждения, в которые поступают пациенты с клиническим диагнозом “пневмония”, сталкиваются с проблемой установления этиологии заболевания и быстрой идентификации возбудителя, поскольку часто вирусные и бактериальные пневмонии характеризуются сходной клинической картиной. Ситуация резко обострилась с возникновением пандемии CoViD-19, для которого необходима своевременная дифференциальная диагностика вторичной бактериальной инфекции, часто возникающей как одно из осложнений при течении болезни.
От своевременной постановки точного диагноза зависит правильный подбор препаратов и стратегия лечения пациента. Сложившаяся ситуация сигнализирует об острой необходимости создания экспресс-методов дифференциальной диагностики.
В настоящем изобретении разработан способ, основанный на мультиплексной ПЦР для видового определения шести основных возбудителей бактериальной пневмонии человека.
Заявляемое изобретение характеризуется тем, что в нём не используется анализ 16s рибосомальной РНК, а затрагиваются только исключительно видоспецифичные гены, что резко увеличивает специфичность анализа. В отличие от аналогов, в заявляемом изобретении применен метод мультиплексной ПЦР, который позволяет выявлять в одном анализе ДНК шести наиболее значимых возбудителей бактериальной пневмонии. Отечественных и зарубежных аналогов не описано.
молекулярная биология, микробиология, медицина
Александр
Чудинов
Васильевич
ведущий научный сотрудник
Кандидат химических наук
Отсутствует
-
-
РОССИЯ
София
Георгиева
Георгиевна
Директор института
РОССИЯ
31.23.29
Нуклеиновые кислоты и их компоненты
34.15.19
Иммобилизованные биологические системы
34.17.15
Молекулярная биофизика
01.04.EE
CHEMISTRY, ORGANIC
01.06.CO
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
01.06.CQ
BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
Александр
Чудинов
Васильевич
координация работ, научное консультирование
РОССИЯ
Сергей
Лапа
Анатольевич
разработка способа, конструирование праймеров, проверка специфичности праймеров, проведение ПЦР, написание патентной заявки
РОССИЯ
Валерий
Шершов
Евгеньевич
синтез праймеров, очистка реактивов и праймеров
РОССИЯ
Александр
Заседателев
Сергеевич
информационное сопровождение, научное консультирование
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ИМБ РАН
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
1037736018066
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения