Программа для анализа длинных некодирующих РНК (АднРНК) / Program for the long non-coding RNA analysis (AlncRNA)
днРНК биоинформатика конвейер
Программа предназначена для предсказания, классификации и структурно-функциональной аннотации длинных некодирующих РНК (днРНК). Программа проводит предварительную обработку данных, идентификацию днРНК, аннотацию днРНК. Входные данные программы включают сборку транскриптома, набор известных днРНК, набор известных мРНК, референсный геном исследуемого организма, аннотацию рефересного генома. Дополнительные данные: координаты мобильных элементов и экспрессия используемых библиотек в тканях. Результатами работы программы являются новые последовательности днРНК, их структурно-функциональная аннотация, анализ экспрессии в тканях, анализ тканеспецифичности, анализ гомологии и классификация на основе их выравнивания относительно белок-кодирующих генов
Программа может быть использована для биоинформатического анализа днРНК в геномах любых организмов.
Елена
Салина
Артемовна
главный научный сотрудник
Доктор биологических наук
Профессор
U-1866-2019
7003403411
РОССИЯ
Алексей
Кочетов
Владимирович
директор
РОССИЯ
34.03.23
Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Артем
Пронозин
Юрьевич
РОССИЯ
Дмитрий
Афонников
Аркадьевич
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Петр
Мордовской
Григорьевич
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ИЦиГ СО РАН
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
1025403657410
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения