База данных ансамбля деревьев для прогнозирования семейной гиперхолестеринемии на основе машинного обучения и секвенирования нового поколения» (АДПСГ)
машинное обучение секвенирование нового поколения семейная гиперхолестеринемия
База данных ансамбля решающих деревьев предназначена для прогнозирования семейной гиперхолестеринемии на основе методов машинного обучения. Решающие правила сохранены в виде представления данных языка разметки для прогнозного моделирования (Predictive Model Markup Language – PMML). Ансамбли деревьев построены на основе размеченной базы данных пациентов с семейной гиперхолестеринемией (RU 2017620408, 07.04.2017) и неразмеченной базы данных биохимии крови с учетом кросс-пересечения параметров. Перечень входных параметров для функционирования решающих деревьев: Глюкоза, Общий холестерин сыворотки, Триглицериды, ХСЛВП – холестерин липопротеинов высокой плотности, ХСЛНП – холестерин липопротеинов низкой плотности, Возраст, Пол, Индекс массы тела, Семейный анамнез (инсульт у родителей, братьев, сестёр до 60 лет), DCLN – lite, Отношение HDL/LDL. Обход деревьев можно организовать при помощи любого инструмента, поддерживающего технологию PMML, например, пакета pypmml языка Питон. База данных состоит из двух ансамблевых наборов: 100 деревьев в каталоге ./restrees с именами от 1 до 100 — деревья, построенные по лабораторно подтверждённым данным с использованием технологии Bootstrap aggregating (Бэггинг), и 100 деревьев в каталоге ./restrees_ex, построенных по частично размеченной комбинированной выборке. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК. ОС: Windows 7/10, Linux.
База данных ансамбля решающих деревьев предназначена для прогнозирования семейной гиперхолестеринемии на основе методов машинного обучения.
Елена
Шахтшнейдер
Владимировна
Ведущий научный сотрудник
Кандидат медицинских наук
Отсутствует
E-9453-2015
6504599985
98089
0000-0001-6108-1025
РОССИЯ
Юлия
Рагино
Игоревна
Руководитель филиала
РОССИЯ
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
03.01.QA
MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL
Елена
Шахтшнейдер
Владимировна
РОССИЯ
Ольга
Тимощенко
Владимировна
РОССИЯ
Сергей
Семаев
Евгеньевич
РОССИЯ
Динара
Иванощук
Евгеньевна
РОССИЯ
РНФ
Российский научный фонд
1137799022261
Организация
Организации, учрежденные юридическими лицами или гражданами, или юридическими лицами и гражданами совместно
Фонды
ИЦИГ СО РАН
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
1025403657410
АЛЕКСЕЙ
КОЧЕТОВ
ВЛАДИМИРОВИЧ
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения