Метагеномная база данных различных биотопов республики Карелия
Метагеном Карелия почва
База данных содержит метагеномную информацию различных биотопов республики Карелия. Используя ГИС технологии, данные космических снимков Карелии были проанализированы с помощью специальных алгоритмов, позволяющих кластеризовать пиксели изображения, согласно их спектральным характеристикам и тем самым были определены места сбора материала. В данной базе данных приведены спектры микроорганизмов для 160 образцов из 43 точек с различными биотопами. Биоинформатический анализ сообществ на основе выбора операционных таксономических единиц (ОТЕ) проводился с использованием алгоритма USEARCH. Соотнесение ОТЕ с таксонами прокариот проводилось путем выравнивания против базы данных Silva128.
База данных представляет интерес для биоинформатиков, молекулярных биологов и специалистам по спутниковому мониторингу для оптимизации экологических исследований и работ по мониторингу.
Создание генетических баз данных
Максим
Патрушев
Владимирович
Заместитель руководителя Комплекса по научной работе
Кандидат биологических наук
Отсутствует
-
-
-
-
РОССИЯ
Сергей
Гиенко
Юрьевич
Начальник управления
РОССИЯ
34.03.21
Таксономия и номенклатура в биологии
01.06.MC
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
Федор
Шарко
Сергеевич
33%
РОССИЯ
Сергей
Расторгуев
Михайлович
34%
РОССИЯ
Мария
Гладышева-Азгари
Викторовна
33%
РОССИЯ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
НИЦ "Курчатовский институт"
федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
1027739576006
Организация
Правительство Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения