Олигонуклеотидные праймеры, флуоресцентные ДНК-зонды и способ выявления Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2 W148 генотипа Beijing в клинических образцах
ТУБЕРКУЛЕЗ, ГЕНОТИП, ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ, ПРАЙМЕРЫ, ДНК-ЗОНДЫ
Способ выявления Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2-W148 генотипа Beijing в клинических образцах, включающий выделение ДНК из клинических образцов или суспензии штаммов, проведение полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием специфических олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентных ДНК-зондов, которые имеют следующие нуклеотидные составы:kdpD F 5"-GGCGGCACGATTTCGGCTAC-3", kdpD R 5"-TCGTCGTCAATCACCAAGACGA-3", PROBE37 FAM-5"-GGCGGGCTCA(LNA-C)AG(LNA-T)GGTGATC-3"-RTQ1, PROBE48 R6G-5"-GGCGGG CTCA(LNA-G)TGGTGATCG(LNA-A)T-3"-BHQ2,при этом режим амплификации 1 цикл 95°C - 15 мин; 45 циклов 95°C -15 с, 65°C - 30 с, а оценку результатов производят путем регистрации сигнала флуоресценции по каналам FAM (520 нм) и R6G (557 нм) и при наблюдении экспоненциального роста сигнала флуоресценции ПЦР по каналу R6G в диапазоне 18-38 цикл амплификации определяют наличие в образце ДНК Mycobacterium tuberculosis клонального комплекса 2-W148 генотипа Beijing.
Группа изобретений относится к медицине, а именно к фтизиатрии, микробиологии, генетике, лабораторной и молекулярной диагностике, и касается олигонуклеотидных праймеров, флуоресцентных ДНК-зондов и способа выявления возбудителя туберкулеза генотипа Beijing, клонального комплекса 2-W148 (CC2-W148) с использованием предлагаемых праймеров и зондов. Группа изобретений может использоваться для ДНК, выделенной из штаммов Mycobacterium tuberculosis, и для ДНК из мокроты, осадка мочи, ликвора, биопсий, аутопсий.
Огарков О.Б.
Гл.н.с.
Доктор медицинских наук
Рычкова Л.В.
Директор
34.15.23
Молекулярная генетика
34.27.59
Эпидемиология микроорганизмов
76.33.43
Эпидемиология
03.03.00
Health sciences
03.01.QA
MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL
03.03.NN
INFECTIOUS DISEASES
Вячеслав
Синьков
Владимирович
Исполнитель
Любовь
Рычкова
Владимировна
Общее руководство
Олег
Огарков
Борисович
Руководство
Светлана
Жданова
Николаевна
Исполнитель
ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
1023801010056
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения
ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека»
1023801010056
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения