Способ определения эффективности обогащения NGS-библиотеки участками экзонов для секвенирования экзома человека
Секвенирование, экзом, эффективность обогащения, кПЦР
Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано для проверки качества образцов, подготавливаемых для высокопроизводительного секвенирования ДНК. Для определения эффективности обогащения NGS-библиотеки участками экзонов для секвенирования экзома человека проводят кПЦР с ДНК человека одной и той же NGS-библиотеки до и после процедуры ее обогащения. Причем каждую ПЦР реакцию проводят, по меньшей мере, с 50 пг ДНК NGS-библиотеки. Определяют эффективность кПЦР реакции и пороговые циклы флуоресцентного сигнала образцов NGS-библиотеки до и после процедуры обогащения. Затем вычисляют эффективность обогащения NGS-библиотеки по приведенной формуле. Технический результат состоит в повышении точности оценки эффективности обогащения NGS-библиотеки.
Возможно применять в процессе приготовления образцов генома человека к высокопроизводительному секвенированию последовательностей экзомов, контролировать качество образцов.
Коростин Д.О.
Старший научный сотрудник
Доктор наук
Лукьянов С. А.
Ректор
76.03.39
Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
76.03.33
Медицинская цитология
02.06.00
Medical engineering
01.06.DR
CELL BIOLOGY
01.06.KM
GENETICS & HEREDITY
Валерий
Черанев
Владимирович
Существенный вклад в эксперименты
Андрей
Кривой
Анатольевич
Основной исполнитель
Дмитрий
Коростин
Олегович
Научный руководитель разработки, формулировка ТЗ
МИНОБРНАУКИ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1187746579690
Организация
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГАОУ ВО РНИМУ ИМ. Н.И. ПИРОГОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "РОССИЙСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ Н.И. ПИРОГОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1027739054420
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения