Способ оценки патотипа и эпидемической/эпизоотической значимости штаммов Escherichia coli,
выделенных в условиях сельскохозяйственного предприятия
Escherichia coli сельскохозяйственное предприятие Способ оценки патотипа Способ оценки эпидемической/эпизоотической значимости
Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано в медицинской и сельскохозяйственной микробиологии, ветеринарии. Культуры Е. coli, изолированные от больных и/или павших сельскохозяйственных животных, а также из подстилки, кормов, поильных систем, абиотических поверхностей доильного оборудования идентифицируют бактериологическим методом. Дополнительно их подвергают молекулярно-генетическому анализу методом ПЦР. Патотип ЕНЕС/ЕТЕС определяют по наличию диареегенных: iha, stx1/ 2, estII - генов адгезина, шигаподобного токсина и термостабильного энтеротоксина b соответственно. Патотип АРЕС определяют по наличию генов экстраинтестинальных групп эшерихий: hlyF, colV - птичьего гемолизина, маркера плазмиды ColV соответственно. Патотип ПРЕС определяют по наличию генов: usp, papGII/ III - уропатогенного специфического белка, пиелонефрит- и цистит-ассоциированных вариантов пилей соответственно. Эпидемическую и эпизоотическую значимость определяют по наличию генов iss, blaCTX-M - фактора выживаемости в сыворотке и бета-лактамазы соответственно. Далее составляют генетический профиль культуры и на основании присутствия соответствующих генов определяют ее группу: DEC или ЕхРЕС, и патотип: ЕНЕС/ЕТЕС, АРЕС или UPEC. Также делают вывод об эпидемической и эпизоотической значимости выделенного штамма. Способ позволяет провести оптимальную и адекватную оценку патотипа (патогенного потенциала), а также эпидемической и эпизоотической значимости штаммов Е. coli, выделенных от сельскохозяйственных животных и/или циркулирующих в условиях сельскохозяйственных предприятий. Способ позволяет эффективно осуществлять контроль над распространением патогенных и цефалоспориноустойчивых полевых Е. coli.
Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано в медицинской и сельскохозяйственной микробиологии,
ветеринарии.
Марина
Кузнецова
Валентиновна
профессор
Кандидат медицинских наук
Профессор
AAI-8419-2021
53264013300
119194
0000-0003-2448-4823
РОССИЯ
Наталия
Минаева
Витальевна
и.о. ректора
РОССИЯ
76.03.43
Медицинская микробиология
01.06.QU
MICROBIOLOGY
Марина
Кузнецова
Валентиновна
Идея, написание текста патента
РОССИЯ
Ольга
Артамонова
Антоновна
Проведение экспериментов (выделение ДНК, детекция маркерных генов)
РОССИЯ
Эрьявец
Старчич
Марьянца
Подбор маркерных генов, поиск прототипов
СЛОВЕНИЯ
Юлия
Поспелова
Сагитовна
Сбор штаммов коллекции, проведение экспериментов (выделение ДНК, детекция маркерных генов), анализ
РОССИЯ
МИНЗДРАВ РОССИИ
МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
1127746460896
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные казенные учреждения
ФГБОУ ВО ПГМУ им. академика Е.А. Вагнера Минздрава России
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего  образования «Пермский государственный медицинский университет имени академика Е.А. Вагнера» Министерства здравоохранения Российской Федерации
1025900528873
Организация
Министерство здравоохранения Российской Федерации
Федеральные государственные бюджетные учреждения